245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6722 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  100 
 
 
353 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  88.95 
 
 
353 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  80.06 
 
 
353 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  49.09 
 
 
363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  49.09 
 
 
363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  48.05 
 
 
361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  49.84 
 
 
363 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  49.37 
 
 
364 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  48.58 
 
 
361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  48.26 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  48.26 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  48.05 
 
 
361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  48.05 
 
 
361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  47.46 
 
 
362 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  47.75 
 
 
361 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  46.73 
 
 
363 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  45.76 
 
 
367 aa  288  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  44.64 
 
 
363 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  45.45 
 
 
348 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  47.83 
 
 
364 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  44.87 
 
 
370 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  45.77 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  46.63 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  43.54 
 
 
361 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  44.05 
 
 
368 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  45.16 
 
 
350 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  43.99 
 
 
357 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  44.12 
 
 
350 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  43.86 
 
 
350 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  45.27 
 
 
370 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  38.63 
 
 
351 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  38.63 
 
 
365 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  37.59 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  34.97 
 
 
365 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  38.59 
 
 
353 aa  199  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  36.18 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  33.23 
 
 
329 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  37 
 
 
329 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  38.6 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  36.97 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  38.6 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  38.25 
 
 
330 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  37.29 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  40 
 
 
328 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  34.85 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  36.09 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  32.78 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  34.55 
 
 
331 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  33.09 
 
 
332 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  32.43 
 
 
332 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  32.37 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  31.8 
 
 
335 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  32.16 
 
 
335 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  32.37 
 
 
332 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  30.15 
 
 
335 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  32.49 
 
 
330 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  27.96 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  31.8 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.45 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  34.22 
 
 
334 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  31.91 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  32.06 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.29 
 
 
303 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.71 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.71 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  26.53 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  26.53 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  27.3 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  26.96 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  26.53 
 
 
458 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  26.96 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771.2  catalase  29.67 
 
 
233 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  26.71 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  26.03 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  24.29 
 
 
512 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2517  Catalase  23.2 
 
 
509 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  23.64 
 
 
499 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  23.66 
 
 
509 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31810  catalase  25 
 
 
738 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  22.71 
 
 
488 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  22.71 
 
 
488 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  22.71 
 
 
488 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  22.71 
 
 
488 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  22.71 
 
 
488 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  22.71 
 
 
449 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  21.6 
 
 
529 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  23.31 
 
 
744 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04660  catalase  23.97 
 
 
504 aa  59.3  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  22.4 
 
 
488 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1629  Catalase  23.63 
 
 
508 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.303359  normal  0.0939595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  22.68 
 
 
555 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  22.15 
 
 
487 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  22.73 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  22.08 
 
 
488 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  23.77 
 
 
516 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  24.15 
 
 
688 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  22.08 
 
 
488 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  22.4 
 
 
488 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  24.91 
 
 
715 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  23.77 
 
 
505 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>