More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2895 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  92 
 
 
350 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  92.57 
 
 
350 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  88.51 
 
 
348 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  100 
 
 
350 aa  709    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  54.87 
 
 
361 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  56.19 
 
 
363 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  54.85 
 
 
362 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  53.69 
 
 
361 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  54.41 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  53.69 
 
 
361 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  54.46 
 
 
361 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  54.46 
 
 
361 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  53.5 
 
 
361 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  52.42 
 
 
363 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  53.99 
 
 
363 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  51.82 
 
 
363 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  52.22 
 
 
364 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  50.45 
 
 
367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  47.69 
 
 
364 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  51.51 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  49.7 
 
 
370 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  48.53 
 
 
366 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  47.6 
 
 
357 aa  298  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  48.25 
 
 
372 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  47.79 
 
 
370 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  44.34 
 
 
365 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  45.25 
 
 
351 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  42.09 
 
 
361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  44.78 
 
 
368 aa  272  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  45.22 
 
 
353 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  43.15 
 
 
353 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  43.67 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  37.65 
 
 
365 aa  233  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  40.26 
 
 
332 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  40.4 
 
 
335 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  40.13 
 
 
353 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  34.45 
 
 
329 aa  222  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  35.5 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  32.41 
 
 
331 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  37.05 
 
 
330 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  34.91 
 
 
329 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  35.31 
 
 
332 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  33.54 
 
 
326 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  33.14 
 
 
332 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  31.96 
 
 
332 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  33.78 
 
 
330 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  32.55 
 
 
332 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  33.11 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  33.91 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  33.22 
 
 
335 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  34.71 
 
 
332 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  33.56 
 
 
335 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  33.56 
 
 
335 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  32.82 
 
 
328 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  31.14 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  34.19 
 
 
334 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.12 
 
 
332 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  32.87 
 
 
335 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  29.93 
 
 
330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  30.03 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  28.45 
 
 
331 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  31.52 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  31.13 
 
 
303 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  26.28 
 
 
459 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  25.94 
 
 
459 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  25.94 
 
 
459 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  25.94 
 
 
459 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  25.6 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  25.25 
 
 
529 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  25.08 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  25.42 
 
 
458 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  26.44 
 
 
459 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  26.71 
 
 
665 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  26.71 
 
 
665 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  25.42 
 
 
459 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  26.9 
 
 
512 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  27.05 
 
 
661 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  27.05 
 
 
665 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  27.21 
 
 
661 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  24.91 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  28.47 
 
 
513 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  24.24 
 
 
682 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  25.76 
 
 
695 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  26.37 
 
 
665 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  27.85 
 
 
511 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  26.37 
 
 
661 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  26.23 
 
 
675 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  25.08 
 
 
689 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  24.5 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  24.17 
 
 
546 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  24.5 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  27.65 
 
 
511 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  27.65 
 
 
511 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  27.65 
 
 
511 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  24.58 
 
 
529 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  26.1 
 
 
728 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  27.46 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  26.1 
 
 
728 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  25.35 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  26.69 
 
 
724 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>