More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0854 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  100 
 
 
331 aa  671    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  45.82 
 
 
334 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  48.21 
 
 
330 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  46.25 
 
 
330 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  46.56 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  45.07 
 
 
329 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  43.94 
 
 
329 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  44.28 
 
 
332 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  46.04 
 
 
330 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  44.11 
 
 
328 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  42.72 
 
 
326 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  43.51 
 
 
332 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  38 
 
 
345 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  34.75 
 
 
362 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  33.65 
 
 
335 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  35.83 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  32.73 
 
 
353 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  35.74 
 
 
364 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  33.92 
 
 
361 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  35.86 
 
 
361 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  35.86 
 
 
361 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  35.62 
 
 
361 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  34.8 
 
 
363 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  34.55 
 
 
353 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  34.02 
 
 
361 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  34.02 
 
 
361 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  34.5 
 
 
363 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  31.41 
 
 
332 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  34.02 
 
 
361 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  35.62 
 
 
363 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  34.22 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  33.55 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  34.44 
 
 
353 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  33.86 
 
 
357 aa  146  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  34.45 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  33.44 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  31.6 
 
 
338 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  28.87 
 
 
365 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  33.99 
 
 
364 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  29.18 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  31.31 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  33.11 
 
 
370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  32.45 
 
 
372 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  30.12 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  28.4 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  30.12 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  30.03 
 
 
350 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  29.35 
 
 
332 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  29.71 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  29.03 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  28.48 
 
 
350 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  29.01 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  29.55 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  29.55 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  28.67 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  28.48 
 
 
363 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  29.63 
 
 
332 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  27.99 
 
 
332 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  27.18 
 
 
335 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  27.27 
 
 
335 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  27.52 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  27.85 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  27.91 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  28.52 
 
 
707 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  27.57 
 
 
684 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  27.87 
 
 
751 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  28.48 
 
 
488 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  28.95 
 
 
488 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  27.91 
 
 
459 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  25.84 
 
 
676 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  27.91 
 
 
708 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  27.91 
 
 
708 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  27.57 
 
 
744 aa  86.3  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  27.91 
 
 
708 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  27.18 
 
 
702 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  28.71 
 
 
724 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  27.57 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  27.91 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  27.91 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  27.91 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  27.91 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  27.91 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  27.91 
 
 
707 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  27.48 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  27.57 
 
 
710 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  27.91 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  26.49 
 
 
682 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  27.57 
 
 
665 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  26.49 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  27.57 
 
 
488 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  27.48 
 
 
458 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  25.5 
 
 
675 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  27.57 
 
 
488 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  24.75 
 
 
491 aa  82.8  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  27.48 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  27.15 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  27.15 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  27.15 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  27.15 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  27.24 
 
 
665 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>