More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5946 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  80 
 
 
329 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  65.76 
 
 
330 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  67.58 
 
 
328 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  66.78 
 
 
330 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  66.67 
 
 
330 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  57.54 
 
 
326 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  53.33 
 
 
329 aa  351  8.999999999999999e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  57.43 
 
 
332 aa  345  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  46.04 
 
 
331 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  48.67 
 
 
334 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  47.19 
 
 
332 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  42.72 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  40.54 
 
 
357 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  40.96 
 
 
370 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  41.39 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  40.26 
 
 
364 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  41.21 
 
 
366 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  38.94 
 
 
361 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  37.29 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  37.62 
 
 
372 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  38.28 
 
 
361 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  38.28 
 
 
361 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  37.39 
 
 
363 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  36.28 
 
 
362 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  38.82 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  38.82 
 
 
363 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  37.83 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  38.28 
 
 
363 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  38.36 
 
 
361 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  36.75 
 
 
353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  36.42 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  37.5 
 
 
350 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  37.38 
 
 
361 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  37.5 
 
 
350 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  37.38 
 
 
361 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  38.28 
 
 
335 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  37.92 
 
 
353 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  35.91 
 
 
348 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  37.05 
 
 
361 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  36.16 
 
 
332 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  33.03 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  36.18 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  36.24 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  36.24 
 
 
351 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  38.28 
 
 
368 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  33 
 
 
367 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  32.93 
 
 
363 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  33 
 
 
361 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  34.97 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  35.86 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  31.85 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  30.36 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  30 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.12 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  30.42 
 
 
335 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  29.62 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  30.47 
 
 
335 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  30.54 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  29.24 
 
 
332 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  32.3 
 
 
330 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  29.13 
 
 
335 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  29.59 
 
 
459 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  29.93 
 
 
458 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  31.42 
 
 
332 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  29.59 
 
 
459 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  30.27 
 
 
459 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  29.25 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  30.15 
 
 
458 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  28.91 
 
 
459 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  28.91 
 
 
459 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  29.15 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  29.15 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  30.1 
 
 
707 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  30.34 
 
 
509 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  30.1 
 
 
710 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  29.76 
 
 
509 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  26.9 
 
 
493 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  30.1 
 
 
516 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  30.1 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  30.1 
 
 
511 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  30.1 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  29.15 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  30.1 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  30.1 
 
 
562 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  28.14 
 
 
665 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  28.09 
 
 
724 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  27.93 
 
 
488 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  29.83 
 
 
689 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  27.93 
 
 
488 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  27.93 
 
 
488 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  27.93 
 
 
488 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  27.93 
 
 
488 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  27.93 
 
 
488 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  27.46 
 
 
684 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  27.93 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  27.8 
 
 
665 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  26.26 
 
 
481 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  27.59 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  29.49 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>