217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5484 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  100 
 
 
353 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  80.06 
 
 
353 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  80.34 
 
 
353 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  47.75 
 
 
361 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  48.18 
 
 
363 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  48.18 
 
 
363 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  48.25 
 
 
363 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  46.13 
 
 
363 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  47.63 
 
 
361 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  45.67 
 
 
362 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  48.43 
 
 
364 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  47.63 
 
 
361 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  47.63 
 
 
361 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  46.55 
 
 
361 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  46.55 
 
 
361 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  46.25 
 
 
361 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  43.06 
 
 
363 aa  285  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  45.02 
 
 
367 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  44.71 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  45.43 
 
 
364 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  42.42 
 
 
348 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  43.24 
 
 
357 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  41.64 
 
 
361 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  45.43 
 
 
366 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  44.23 
 
 
350 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  44.63 
 
 
372 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  43.11 
 
 
350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  43.27 
 
 
350 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  45.8 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  41.6 
 
 
368 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  39.44 
 
 
365 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  39.44 
 
 
351 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  38 
 
 
332 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  38.49 
 
 
335 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  34.27 
 
 
365 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  33.12 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  38.59 
 
 
353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  37.33 
 
 
329 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  36.33 
 
 
330 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  36.75 
 
 
330 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  36 
 
 
330 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  37.54 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  35.29 
 
 
329 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  38.27 
 
 
328 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  36.96 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  34.65 
 
 
338 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  33.33 
 
 
326 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.13 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  33.55 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  27.81 
 
 
331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  35.22 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  30.58 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  31.67 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  31.43 
 
 
332 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  30.74 
 
 
335 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  30.04 
 
 
335 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  30.88 
 
 
335 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  31.36 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  30.14 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  29.68 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  29.6 
 
 
330 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  31.23 
 
 
332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  32.15 
 
 
303 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771.2  catalase  26.92 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  23.97 
 
 
459 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  23.97 
 
 
459 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  24.92 
 
 
499 aa  63.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  23.97 
 
 
459 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  23.97 
 
 
459 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  23.97 
 
 
458 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  23.97 
 
 
459 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  23.63 
 
 
459 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  24.3 
 
 
555 aa  59.7  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  23.63 
 
 
459 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  23.63 
 
 
458 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  23.9 
 
 
512 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  23.63 
 
 
458 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0449  Catalase  22.12 
 
 
485 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04660  catalase  24.15 
 
 
504 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.651811  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  23.63 
 
 
744 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  24.14 
 
 
483 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2517  Catalase  23.2 
 
 
509 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31810  catalase  23.97 
 
 
738 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  24.49 
 
 
715 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  24.53 
 
 
517 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  23.62 
 
 
488 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  23.62 
 
 
449 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  23.62 
 
 
488 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  23.62 
 
 
488 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  23.62 
 
 
488 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  23.62 
 
 
488 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0222  Catalase  25.17 
 
 
484 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  23.46 
 
 
501 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  23.34 
 
 
507 aa  53.1  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  22.03 
 
 
554 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  22.67 
 
 
478 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  23.31 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1629  Catalase  24.49 
 
 
508 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.303359  normal  0.0939595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  21.82 
 
 
529 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  22.53 
 
 
682 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>