More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2314 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  99.09 
 
 
330 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  90 
 
 
330 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  80 
 
 
328 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  68.29 
 
 
329 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  65.15 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  56.21 
 
 
329 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  54.32 
 
 
326 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  53.49 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  48.04 
 
 
334 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  44.41 
 
 
331 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  44.19 
 
 
332 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  40.27 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  40.46 
 
 
366 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  37.46 
 
 
357 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  38.44 
 
 
370 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  38.6 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  37.38 
 
 
361 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  35.62 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  37.05 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  37.05 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  37.19 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  37.42 
 
 
364 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  36.93 
 
 
364 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  36.25 
 
 
363 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  36.07 
 
 
361 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  36.27 
 
 
361 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  36.27 
 
 
361 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  37.08 
 
 
370 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  35.76 
 
 
363 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  35.94 
 
 
363 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  34.35 
 
 
332 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  35.64 
 
 
372 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  35.95 
 
 
361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  36.49 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  34.36 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  35.17 
 
 
363 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  38.41 
 
 
353 aa  162  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  30.06 
 
 
365 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  35 
 
 
368 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  32.62 
 
 
363 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  32.67 
 
 
331 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  33.92 
 
 
351 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  33.92 
 
 
365 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  30.77 
 
 
367 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  33.89 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  32.59 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  31.25 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  31.92 
 
 
350 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  29.88 
 
 
348 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  29.93 
 
 
350 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  31.82 
 
 
361 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.9 
 
 
303 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  33.91 
 
 
330 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  31.23 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  29.5 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.23 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  30.63 
 
 
335 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  30.33 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  29.2 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  28.61 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  30.82 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  32.66 
 
 
332 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  26.85 
 
 
458 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  28.96 
 
 
744 aa  89.4  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  27.72 
 
 
682 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  26.85 
 
 
459 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  26.85 
 
 
459 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  28.09 
 
 
676 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  27.95 
 
 
504 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.54 
 
 
459 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.54 
 
 
459 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  28.72 
 
 
509 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  28.38 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  27.46 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  28.38 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  29.29 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  28.38 
 
 
511 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  28.38 
 
 
511 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  27.03 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  27.7 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  27.03 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  28.38 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  28.38 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  28.95 
 
 
716 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  27.7 
 
 
503 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  26.25 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  27.76 
 
 
675 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  27.8 
 
 
509 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  27.61 
 
 
488 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09339  Catalase B Precursor (EC 1.11.1.6) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P78619]  27.27 
 
 
722 aa  82.4  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  24.77 
 
 
458 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  25.93 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  26.95 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  27.3 
 
 
493 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  27.09 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  27.7 
 
 
567 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  28.76 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  28.14 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  26.64 
 
 
684 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>