More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4343 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  100 
 
 
303 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  34.45 
 
 
331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  34.11 
 
 
326 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  34.21 
 
 
332 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.96 
 
 
332 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  35.64 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  35.86 
 
 
330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  31.73 
 
 
329 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  33.67 
 
 
328 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  31.23 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  30.9 
 
 
330 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  30.9 
 
 
330 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  32.35 
 
 
335 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  29.74 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  32.57 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  34.15 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  31.4 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  29.11 
 
 
334 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  30.29 
 
 
353 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  31.58 
 
 
362 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  29.55 
 
 
364 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  30.07 
 
 
361 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  32.15 
 
 
353 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  30.84 
 
 
364 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  27.51 
 
 
365 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  32.04 
 
 
353 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  29.74 
 
 
361 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  29.74 
 
 
361 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  31.13 
 
 
350 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  31.09 
 
 
363 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  32.26 
 
 
366 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  30.19 
 
 
361 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  31.09 
 
 
363 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  30.26 
 
 
348 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  30.74 
 
 
363 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  29.35 
 
 
367 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  31.29 
 
 
372 aa  95.9  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  29.87 
 
 
361 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  29.87 
 
 
361 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  30.46 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  30.46 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  30.25 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  31.07 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  30.53 
 
 
361 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  29.55 
 
 
361 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  30.13 
 
 
370 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  25.08 
 
 
338 aa  89.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  27.33 
 
 
458 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  29 
 
 
459 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  28.67 
 
 
459 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  28.33 
 
 
458 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  28.71 
 
 
458 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  28.57 
 
 
459 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  29.45 
 
 
351 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  29.45 
 
 
365 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  26.71 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  26.69 
 
 
459 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  28.33 
 
 
459 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  28.33 
 
 
459 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  26.13 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  29.37 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  28.35 
 
 
512 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  28.2 
 
 
716 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  27.3 
 
 
752 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  27.03 
 
 
501 aa  79.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  27.87 
 
 
716 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  26.56 
 
 
750 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  27.27 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  27.24 
 
 
504 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  26.56 
 
 
750 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  25.83 
 
 
751 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  26.56 
 
 
750 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  25.34 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  30.28 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  25.16 
 
 
527 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  26.44 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  26.56 
 
 
750 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  26.56 
 
 
750 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  26.12 
 
 
493 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  26.47 
 
 
753 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  28.62 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  26.89 
 
 
753 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  26.47 
 
 
753 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  24.37 
 
 
480 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  26.97 
 
 
724 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  27.7 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0903  catalase  26.26 
 
 
504 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  26.89 
 
 
753 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  26.89 
 
 
753 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.321432 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  26.89 
 
 
753 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  24.92 
 
 
483 aa  76.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  26.89 
 
 
753 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  26.89 
 
 
753 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  26.96 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  26.96 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1320  catalase  26.65 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0546  Catalase  25.33 
 
 
574 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  25.32 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  27.22 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  27.12 
 
 
713 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>