More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2803 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  92 
 
 
350 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  98.86 
 
 
350 aa  697    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  100 
 
 
350 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  88.22 
 
 
348 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  55.46 
 
 
361 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  55.89 
 
 
363 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  55.15 
 
 
362 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  54.46 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  53.33 
 
 
363 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  55.32 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  55.32 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  55.32 
 
 
361 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  54.78 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  54.78 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  53.03 
 
 
363 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  54.95 
 
 
363 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  53.8 
 
 
364 aa  359  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  51.04 
 
 
367 aa  345  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  54.82 
 
 
363 aa  342  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  49.13 
 
 
364 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  50.3 
 
 
370 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  49.7 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  48.07 
 
 
357 aa  301  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  48.67 
 
 
370 aa  298  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  46.92 
 
 
372 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  43.84 
 
 
361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  44.95 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  45.89 
 
 
351 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  45.59 
 
 
368 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  44.9 
 
 
353 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  43.41 
 
 
353 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  43.63 
 
 
353 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  37.24 
 
 
365 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  42.38 
 
 
335 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  40.47 
 
 
353 aa  229  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  39.6 
 
 
332 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  35.06 
 
 
329 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  35.69 
 
 
338 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  37.88 
 
 
330 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  35.97 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  36.06 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  31.48 
 
 
331 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  35.8 
 
 
329 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  33.72 
 
 
332 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  35.41 
 
 
329 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  33.14 
 
 
332 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  32.34 
 
 
330 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  33.14 
 
 
332 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  34.6 
 
 
335 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  32.12 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  35.17 
 
 
335 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  35.17 
 
 
335 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  33.03 
 
 
328 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  31.44 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  34.47 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  34.48 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  30.92 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  34.53 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  31.02 
 
 
330 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  34.39 
 
 
334 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  33.22 
 
 
345 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  29.88 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.46 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  25.93 
 
 
529 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  26.62 
 
 
459 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.28 
 
 
459 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.28 
 
 
459 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  26.28 
 
 
459 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  27.99 
 
 
512 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  25.94 
 
 
459 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  25.94 
 
 
458 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  25.6 
 
 
459 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  25.6 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  26.37 
 
 
665 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  26.44 
 
 
665 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  27.74 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  27.12 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  25.85 
 
 
509 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  26.78 
 
 
661 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  28.86 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  28.19 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  26.78 
 
 
665 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  27.95 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  24.83 
 
 
682 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  26.44 
 
 
695 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  26.78 
 
 
661 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  28.47 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  28.33 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  28.33 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  28.33 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  27.12 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  24.58 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  25.42 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  25.15 
 
 
504 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  28.47 
 
 
513 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  27.46 
 
 
711 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  25.91 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  26.23 
 
 
675 aa  76.3  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  25.08 
 
 
527 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  25.68 
 
 
661 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>