More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6719 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  100 
 
 
326 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  62.25 
 
 
332 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  57.93 
 
 
329 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  57.62 
 
 
329 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  57.54 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  54.85 
 
 
330 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  55.99 
 
 
330 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  55.7 
 
 
330 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  55.69 
 
 
328 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  47.14 
 
 
334 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  42.72 
 
 
331 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  43.75 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  39.88 
 
 
345 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  33.54 
 
 
365 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  37.12 
 
 
363 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  34.57 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  36.24 
 
 
362 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  36.56 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  35.55 
 
 
361 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  34.95 
 
 
372 aa  172  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  38.13 
 
 
364 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  35.88 
 
 
361 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  35.88 
 
 
361 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  34.66 
 
 
361 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  35.55 
 
 
361 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  35.55 
 
 
361 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  34.88 
 
 
361 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  34.19 
 
 
335 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  35.79 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  35.43 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  32.78 
 
 
353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  36.21 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  35.19 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  35.43 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  34.81 
 
 
357 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  36.21 
 
 
350 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  35.1 
 
 
348 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  33.22 
 
 
353 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  35.1 
 
 
363 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  31.38 
 
 
367 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  35.89 
 
 
353 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  34.67 
 
 
350 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  33.64 
 
 
363 aa  155  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  33.33 
 
 
353 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  34.27 
 
 
351 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  34.27 
 
 
365 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  34.22 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  32.44 
 
 
361 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  34.67 
 
 
370 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  34.11 
 
 
331 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  34.11 
 
 
303 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  30.97 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  32.63 
 
 
338 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  30.62 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.53 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  30.93 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  30.29 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  30.16 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  30.93 
 
 
335 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  31.41 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  30.62 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  30.03 
 
 
335 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  28.14 
 
 
661 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  28.94 
 
 
332 aa  92.8  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  29.55 
 
 
511 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  28.28 
 
 
665 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  28.28 
 
 
661 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  27.46 
 
 
665 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  27.46 
 
 
665 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  29.55 
 
 
511 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  29.55 
 
 
511 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  29.55 
 
 
511 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  29.66 
 
 
510 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  27.46 
 
 
661 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  27.46 
 
 
665 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  29.08 
 
 
507 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  30 
 
 
510 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  26.44 
 
 
675 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  28.62 
 
 
712 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  27.89 
 
 
684 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  27.89 
 
 
744 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  25.85 
 
 
682 aa  85.9  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  27.03 
 
 
552 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  28.72 
 
 
716 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  28.62 
 
 
689 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  25.76 
 
 
676 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  28.38 
 
 
702 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  28.38 
 
 
529 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  28.38 
 
 
708 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  28.38 
 
 
708 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  28.38 
 
 
708 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  26.03 
 
 
489 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09339  Catalase B Precursor (EC 1.11.1.6) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P78619]  26.83 
 
 
722 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  28.04 
 
 
702 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  27.7 
 
 
704 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  27.7 
 
 
704 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  28.04 
 
 
529 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  28.52 
 
 
510 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  27.36 
 
 
704 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  28.04 
 
 
529 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>