More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0230 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  714    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  96.36 
 
 		 370 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  79.27 
 
 		 366 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  79.27 
 
 		 370 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  58.52 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  53.45 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  53.31 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  50.75 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  52.51 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  51.65 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  51.65 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  49.57 
 
 		 363 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  51.35 
 
 		 361 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  49.57 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  49.85 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  49.24 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  49.24 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  50 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  50.63 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  47.15 
 
 		 348 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  48.24 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  48.66 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  48.07 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  47.6 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  44.31 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  41.69 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  43.24 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  42.35 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  44.48 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  41.72 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  44.1 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  44.1 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  43.09 
 
 		 335 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  43.93 
 
 		 353 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  38.44 
 
 		 329 aa  235  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  40.45 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  38.1 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  35.96 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  40.54 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  37.79 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  37.46 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  36.12 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  37.1 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  33.45 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  35.48 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  34.81 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  36.2 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  33.86 
 
 		 331 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.22 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  33.12 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  31.1 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  30.72 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  28.98 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  32.48 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  30.14 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  28.92 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  29.25 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.25 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  28.05 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  27.09 
 
 		 552 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  27.04 
 
 		 507 aa  86.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  26.76 
 
 		 554 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  25.86 
 
 		 509 aa  85.9  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  27.56 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  26.76 
 
 		 552 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  26.42 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  27.19 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  25.79 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  27.19 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  27.19 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  27.19 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  27.19 
 
 		 511 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  28.52 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  27.12 
 
 		 506 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  27.12 
 
 		 506 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  27.95 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  27.95 
 
 		 483 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  28.84 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  28.42 
 
 		 562 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  27.01 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  27.05 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  25.51 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  27.03 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  25.99 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  25.16 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  27.61 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  25.52 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  27.67 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  27.33 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  28.19 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  28.66 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  25.62 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  27.95 
 
 		 547 aa  79.7  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  28.62 
 
 		 493 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3278  catalase  25.33 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>