299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2517 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  97.29 
 
 
332 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  683    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  97.59 
 
 
332 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  77.64 
 
 
335 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  77.64 
 
 
335 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  77.34 
 
 
335 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  77.64 
 
 
335 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  74.85 
 
 
335 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  69.7 
 
 
332 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  68.1 
 
 
330 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771.2  catalase  81.36 
 
 
233 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  34.34 
 
 
353 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  34.63 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  33.33 
 
 
332 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  35.19 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  31.8 
 
 
365 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  34.84 
 
 
350 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  34.84 
 
 
350 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  34.74 
 
 
361 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  34.84 
 
 
350 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  32.15 
 
 
362 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  31.38 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  32.37 
 
 
353 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  33.22 
 
 
364 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  33.1 
 
 
361 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  33.1 
 
 
361 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  33.68 
 
 
363 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  32.76 
 
 
361 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  33.56 
 
 
361 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  34.15 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  33.33 
 
 
361 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  33.33 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  33.33 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  33.33 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  33.68 
 
 
363 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  31.65 
 
 
353 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  31.43 
 
 
353 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  31.71 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  31.47 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  32.42 
 
 
363 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  30.56 
 
 
372 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  30.28 
 
 
330 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  26.69 
 
 
331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  26.86 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  26.86 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  29.69 
 
 
370 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  28.32 
 
 
368 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  30.06 
 
 
332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  29.78 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  30.42 
 
 
330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  28.92 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  30.42 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  30.62 
 
 
326 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  28.86 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  28.67 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  29.24 
 
 
330 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  27.83 
 
 
329 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  28.19 
 
 
328 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  28.87 
 
 
370 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  28.28 
 
 
366 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  26.72 
 
 
345 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  27.08 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  23.86 
 
 
682 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  25.93 
 
 
704 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  25.58 
 
 
711 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  26.75 
 
 
665 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  26.75 
 
 
661 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  26.75 
 
 
661 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  26.4 
 
 
716 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  26.43 
 
 
665 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  26.43 
 
 
665 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  25.25 
 
 
676 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  24.92 
 
 
724 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  24.92 
 
 
675 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  26.24 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  26.43 
 
 
665 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  25.33 
 
 
705 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  26.43 
 
 
661 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  25.58 
 
 
752 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  25.74 
 
 
705 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  25.84 
 
 
705 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  25.74 
 
 
710 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  25.25 
 
 
750 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  25.25 
 
 
750 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  25.25 
 
 
750 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  25.25 
 
 
750 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  25.33 
 
 
716 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  25.25 
 
 
750 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  25.91 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  26 
 
 
713 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  24.92 
 
 
753 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  25.08 
 
 
794 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  24.92 
 
 
753 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  24.75 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  24.92 
 
 
753 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  24.67 
 
 
459 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  24.92 
 
 
753 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  25.25 
 
 
709 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  24.92 
 
 
753 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.321432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>