More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2887 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  100 
 
 		 350 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  88.79 
 
 		 348 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  92.57 
 
 		 350 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  98.86 
 
 		 350 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  56.64 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  55.56 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  54.08 
 
 		 363 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  55.76 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  55.46 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  55.1 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  55.41 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  56.23 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  53.94 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  55.41 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  55.46 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  55.59 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  54.11 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  50.73 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  54.95 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  49.42 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  50.9 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  50 
 
 		 366 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  48.66 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  49.56 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  47.8 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  45.26 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  43.53 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  45.4 
 
 		 351 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  45.81 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  45.54 
 
 		 353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  44.01 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  44.27 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  42.38 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  36.66 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  40.8 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  39.6 
 
 		 332 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  35.06 
 
 		 329 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  36.01 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  37.88 
 
 		 330 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  36.3 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  36.21 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  32.12 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  35.5 
 
 		 329 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  35.41 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  35.54 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  34.84 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  32.34 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  34.84 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  34.6 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  32.12 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  33.44 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  35.17 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  35.17 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  31.44 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  34.47 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  34.48 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  30.92 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  31.02 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  34.84 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  34.39 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  33.55 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  30.18 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.46 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  26.62 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.28 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.28 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  25.93 
 
 		 529 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  26.28 
 
 		 459 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  27.93 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  25.94 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  25.94 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  25.6 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  25.6 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  27.12 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  26.37 
 
 		 665 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  26.37 
 
 		 665 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  27.74 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  28.19 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  25.85 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  26.78 
 
 		 661 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  27.95 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  28.86 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  26.71 
 
 		 665 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  26.1 
 
 		 695 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  28.47 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  25.42 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  24.58 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  26.78 
 
 		 661 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  25.25 
 
 		 682 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  28.33 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  27.12 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  28.33 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  28.33 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  25.15 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  28.47 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  25.91 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  25.9 
 
 		 675 aa  77  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  25.08 
 
 		 527 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  25.68 
 
 		 665 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  25.68 
 
 		 661 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>