More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2390 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  100 
 
 
348 aa  704    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  88.79 
 
 
350 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  88.51 
 
 
350 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  88.22 
 
 
350 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  55.59 
 
 
363 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  55.76 
 
 
362 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  52.92 
 
 
361 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  53 
 
 
361 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  51.75 
 
 
361 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  51.75 
 
 
361 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  52.05 
 
 
361 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  52.05 
 
 
361 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  51.42 
 
 
361 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  50.75 
 
 
363 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  50.75 
 
 
363 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  52.06 
 
 
363 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  49.41 
 
 
367 aa  343  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  52.74 
 
 
363 aa  342  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  50.94 
 
 
364 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  48.96 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  49.25 
 
 
370 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  48.79 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  47.15 
 
 
357 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  48.65 
 
 
370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  47.66 
 
 
372 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  45.87 
 
 
365 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  46.42 
 
 
351 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  46.81 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  42.94 
 
 
361 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  45.22 
 
 
353 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  42.42 
 
 
353 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  43.63 
 
 
353 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  41.39 
 
 
335 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  39.63 
 
 
332 aa  235  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  36.88 
 
 
329 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  36.45 
 
 
365 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  40.6 
 
 
353 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  36.48 
 
 
338 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  32 
 
 
331 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  35.91 
 
 
330 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  35.01 
 
 
329 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  35.1 
 
 
326 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  34.65 
 
 
332 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  34.95 
 
 
329 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  32.22 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  34.84 
 
 
332 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  33.45 
 
 
332 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  31.58 
 
 
328 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  34.15 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  34.26 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  33.99 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  30.84 
 
 
330 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  34.83 
 
 
335 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  34.83 
 
 
335 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  33.22 
 
 
335 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  29.61 
 
 
330 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  30.03 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  33.33 
 
 
334 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  34.19 
 
 
332 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  34.14 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  29.03 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  31.17 
 
 
345 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.26 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  29.08 
 
 
512 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  28.96 
 
 
665 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  28.96 
 
 
665 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  28.62 
 
 
511 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  28.77 
 
 
511 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  28.77 
 
 
511 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  28.77 
 
 
511 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  28.47 
 
 
661 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  28.62 
 
 
665 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  27.74 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  28.28 
 
 
661 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  28.19 
 
 
724 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  24.66 
 
 
529 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  27.85 
 
 
728 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  25.26 
 
 
459 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  26.4 
 
 
695 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  27.95 
 
 
665 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  27.8 
 
 
661 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  28.23 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  24.91 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  24.91 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  24.91 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  25.42 
 
 
675 aa  80.1  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  28.19 
 
 
507 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  27.46 
 
 
728 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  27.95 
 
 
513 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  28.23 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  28.52 
 
 
711 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  26.35 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  26.17 
 
 
682 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  25.68 
 
 
527 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  28.19 
 
 
716 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  28.52 
 
 
711 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  24.91 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  26.1 
 
 
702 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  26.44 
 
 
702 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  24.57 
 
 
458 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>