More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0174 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  100 
 
 
370 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  96.36 
 
 
357 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  80.54 
 
 
366 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  81.08 
 
 
370 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  58.99 
 
 
372 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  54.76 
 
 
362 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  55.17 
 
 
363 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  51.16 
 
 
361 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  51.74 
 
 
361 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  51.74 
 
 
361 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  51.01 
 
 
363 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  51.45 
 
 
361 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  51.01 
 
 
363 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  52.8 
 
 
368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  51.06 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  50.45 
 
 
361 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  50.45 
 
 
361 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  51.2 
 
 
364 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  49.25 
 
 
348 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  50.76 
 
 
363 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  50 
 
 
364 aa  311  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  50.9 
 
 
350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  50.3 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  49.7 
 
 
350 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  45.81 
 
 
363 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  44.15 
 
 
361 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  44.71 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  41.78 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  45.11 
 
 
353 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  43.71 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  45.14 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  42.05 
 
 
365 aa  252  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  43.85 
 
 
353 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  43.75 
 
 
335 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  39.87 
 
 
329 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  41.1 
 
 
332 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  38.99 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  36.54 
 
 
338 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  37.12 
 
 
353 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  38.76 
 
 
330 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  38.44 
 
 
330 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  40.96 
 
 
330 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  37.12 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  30.17 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  35.62 
 
 
332 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  35.19 
 
 
326 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  36.79 
 
 
328 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  33.99 
 
 
329 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  33.44 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.22 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  33.12 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  31.8 
 
 
330 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  30.72 
 
 
332 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  28.98 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  30.48 
 
 
335 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  29.69 
 
 
332 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  31.83 
 
 
345 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  30.14 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  29.69 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 
335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 
335 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  28.24 
 
 
554 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  26.91 
 
 
507 aa  93.2  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.13 
 
 
303 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  28.62 
 
 
527 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  25.15 
 
 
507 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  27.01 
 
 
510 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  27.3 
 
 
506 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  27.3 
 
 
506 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  27.72 
 
 
485 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  25.71 
 
 
509 aa  89.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  27.09 
 
 
552 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  25.28 
 
 
510 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  27.67 
 
 
516 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  27.67 
 
 
505 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  27.67 
 
 
511 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  26.76 
 
 
552 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  27.67 
 
 
511 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  26.42 
 
 
555 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  25.9 
 
 
510 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  27.67 
 
 
511 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  26.32 
 
 
493 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  25.71 
 
 
513 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  28.84 
 
 
499 aa  86.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  25.94 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  29.11 
 
 
562 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  28.05 
 
 
486 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  26.03 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  26.97 
 
 
496 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  24.93 
 
 
512 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  28.28 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  25.68 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  27 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  27.33 
 
 
517 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  26.28 
 
 
504 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  27.85 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  27.19 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  26.94 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  27.19 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>