More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3328 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  100 
 
 
331 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  38.91 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  37.94 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  36.55 
 
 
365 aa  195  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  34.84 
 
 
329 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  32.62 
 
 
362 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  32.83 
 
 
367 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  33.94 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  32.82 
 
 
363 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  33.45 
 
 
357 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  31.46 
 
 
338 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  32 
 
 
348 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  30.17 
 
 
370 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  32.57 
 
 
350 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  32.12 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  32.12 
 
 
350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  29.84 
 
 
361 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  29.84 
 
 
361 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  29.84 
 
 
361 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  28.74 
 
 
366 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  28.53 
 
 
361 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  30.69 
 
 
364 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  30.34 
 
 
363 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  30.28 
 
 
351 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  30.28 
 
 
365 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  28.85 
 
 
363 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  30 
 
 
363 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  32.67 
 
 
330 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  29.28 
 
 
361 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  29.28 
 
 
361 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  29.34 
 
 
363 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  32.34 
 
 
330 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  28.62 
 
 
361 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  29.34 
 
 
370 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  34.11 
 
 
326 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  27.81 
 
 
353 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  27.99 
 
 
368 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  29.45 
 
 
364 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  29.52 
 
 
330 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  31.72 
 
 
329 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  28.12 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  29.45 
 
 
353 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  30.75 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  32 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  28.57 
 
 
353 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  29.64 
 
 
372 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  32.34 
 
 
330 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  31.31 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  29.83 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  30.75 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  30.36 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  29.17 
 
 
335 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  28.92 
 
 
335 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  28.29 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  26.69 
 
 
332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  28.72 
 
 
335 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  28.04 
 
 
345 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  27.89 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  29.59 
 
 
334 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  27.3 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  28.08 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  26.33 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  26.67 
 
 
449 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  26.67 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  26.67 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  26.67 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  26.67 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  26.67 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  26.67 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  27.3 
 
 
665 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  27.57 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  27.3 
 
 
665 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  27.48 
 
 
684 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  27.3 
 
 
661 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  27.3 
 
 
665 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  27.3 
 
 
661 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  27.3 
 
 
661 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  27.3 
 
 
665 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771.2  catalase  30.05 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  25.67 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  27.24 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  25.34 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  25.93 
 
 
488 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1993  catalase  26.11 
 
 
729 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.219349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5148  catalase  27.06 
 
 
744 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821029  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5060  catalase  27.06 
 
 
744 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  25.16 
 
 
689 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5439  catalase  26.73 
 
 
744 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.441674  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  25.17 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  24.83 
 
 
704 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1733  Catalase  26.4 
 
 
738 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  24.83 
 
 
704 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  27.3 
 
 
716 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  26 
 
 
566 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  29.95 
 
 
713 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  24.5 
 
 
704 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  26.71 
 
 
741 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  27.1 
 
 
744 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  26.51 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  25.33 
 
 
702 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>