More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1888 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  83.12 
 
 
330 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  82.74 
 
 
330 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  80.91 
 
 
330 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  69.66 
 
 
329 aa  454  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  67.58 
 
 
330 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  60.66 
 
 
329 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  55.69 
 
 
326 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  54.3 
 
 
332 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  47.74 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  44.11 
 
 
331 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  43.6 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  38.26 
 
 
345 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  40 
 
 
353 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  38.94 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  38.27 
 
 
353 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  38.28 
 
 
361 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  38.28 
 
 
361 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  39.65 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  37.86 
 
 
361 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  37.38 
 
 
363 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  38.06 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  37.85 
 
 
363 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  37.07 
 
 
363 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  36.42 
 
 
362 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  35.83 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  37.54 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  37.22 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  36.2 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  37.22 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  39.14 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  38.03 
 
 
364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  36.79 
 
 
370 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  36.96 
 
 
372 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  36.89 
 
 
361 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  34.33 
 
 
332 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  37.12 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  31.76 
 
 
365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  35.4 
 
 
368 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  37.42 
 
 
370 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  35.2 
 
 
350 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  34.87 
 
 
350 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  32.82 
 
 
348 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  34.21 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  34.03 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  34.03 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  30.89 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  30.12 
 
 
363 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  33.02 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  29.97 
 
 
367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  33.44 
 
 
303 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  31.17 
 
 
331 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  31.77 
 
 
361 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  29.04 
 
 
332 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  30.86 
 
 
330 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  30.38 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  29.04 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  29.79 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  28.44 
 
 
332 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  29.85 
 
 
335 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  30.25 
 
 
332 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  27.11 
 
 
458 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  30.48 
 
 
510 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  30.72 
 
 
510 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  26.53 
 
 
459 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  26.53 
 
 
459 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  26.45 
 
 
458 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.24 
 
 
459 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.24 
 
 
459 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  29.07 
 
 
507 aa  93.2  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  25.95 
 
 
458 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  26.67 
 
 
459 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  29.53 
 
 
707 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  26.76 
 
 
459 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  29.45 
 
 
513 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  28.77 
 
 
513 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  29.45 
 
 
509 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  28.66 
 
 
511 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  30.03 
 
 
504 aa  89.7  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  28.66 
 
 
511 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  28.66 
 
 
511 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  29.45 
 
 
513 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  27.81 
 
 
459 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  29.53 
 
 
710 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  29.05 
 
 
684 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  28.18 
 
 
512 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  28.52 
 
 
503 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  29.53 
 
 
716 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  29.69 
 
 
527 aa  85.9  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  28.62 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  28.04 
 
 
707 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  28.62 
 
 
516 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  28.62 
 
 
511 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  27.81 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  27.8 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  27.8 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  28.62 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  28.62 
 
 
505 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>