More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2365 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  100 
 
 
345 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  45.15 
 
 
334 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  44.48 
 
 
332 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  42.62 
 
 
329 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  40.27 
 
 
330 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  40.75 
 
 
332 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  39.86 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  42.43 
 
 
330 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  40.79 
 
 
329 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  39.16 
 
 
330 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  38 
 
 
331 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  39.88 
 
 
326 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  38.26 
 
 
328 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  33.87 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  31.7 
 
 
365 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  33.05 
 
 
367 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  35.2 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  33.12 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  34.87 
 
 
361 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  34.87 
 
 
361 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  31.36 
 
 
353 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  34.01 
 
 
361 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  32.85 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  35.43 
 
 
364 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  32.56 
 
 
363 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  32.13 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  30.79 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  33.77 
 
 
361 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  33.77 
 
 
361 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  33.44 
 
 
363 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  33.55 
 
 
366 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  32.56 
 
 
362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  29.9 
 
 
361 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  33.44 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  33.44 
 
 
350 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  32.45 
 
 
353 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  28.16 
 
 
329 aa  133  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  33.55 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  34.97 
 
 
364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  32.33 
 
 
353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  29.71 
 
 
363 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  32.88 
 
 
363 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  32.48 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  31.83 
 
 
370 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  33.66 
 
 
368 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  31.91 
 
 
350 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  29.68 
 
 
351 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  30 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  28.28 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  32.47 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  30.92 
 
 
372 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  31.07 
 
 
348 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  31.56 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  26.72 
 
 
332 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  26.72 
 
 
332 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  27.27 
 
 
330 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  26.44 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  28.43 
 
 
332 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  26.3 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  31.11 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  30.56 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  25.38 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  30.56 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  27.46 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  25.99 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  26.91 
 
 
503 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  25.99 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  28.72 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  26.3 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  26.06 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  25.6 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  25.69 
 
 
459 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  25.26 
 
 
554 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  25.69 
 
 
459 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  26.3 
 
 
459 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  26.32 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  25.75 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  25.96 
 
 
665 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  25.96 
 
 
665 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  25.96 
 
 
665 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  25.96 
 
 
661 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  25.96 
 
 
661 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  25 
 
 
486 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  25.26 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  25.96 
 
 
661 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  26.62 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  24.31 
 
 
486 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  24.91 
 
 
552 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  25 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  26.71 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  25.96 
 
 
665 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  24.31 
 
 
486 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  24.31 
 
 
486 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  24.31 
 
 
486 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  25.85 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  25.58 
 
 
506 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  25.58 
 
 
506 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  25.08 
 
 
684 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  26.54 
 
 
715 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  27.15 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>