More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4410 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  100 
 
 
366 aa  721    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  80.54 
 
 
370 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  79.27 
 
 
357 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  77.63 
 
 
370 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  59.09 
 
 
372 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  57.1 
 
 
362 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  54.05 
 
 
363 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  51.32 
 
 
361 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  51.91 
 
 
361 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  51.91 
 
 
361 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  51.61 
 
 
361 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  51.46 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  51.46 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  53.69 
 
 
368 aa  325  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  52.38 
 
 
361 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  53.48 
 
 
364 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  52.72 
 
 
363 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  51.43 
 
 
361 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  51.43 
 
 
361 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  48.79 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  50 
 
 
350 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  49.7 
 
 
350 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  50 
 
 
364 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  48.53 
 
 
350 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  44.63 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  43.41 
 
 
363 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  42.51 
 
 
367 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  45.43 
 
 
353 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  46.37 
 
 
353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  47.02 
 
 
353 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  42.55 
 
 
365 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  43.57 
 
 
351 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  41.45 
 
 
365 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  42.76 
 
 
335 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  40.07 
 
 
332 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  37.81 
 
 
329 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  38.41 
 
 
353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  41.12 
 
 
330 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  35.18 
 
 
338 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  40.46 
 
 
330 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  39.36 
 
 
329 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  41.21 
 
 
330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  39.47 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  37.42 
 
 
332 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  35.79 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  36.09 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  39.14 
 
 
328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  28.74 
 
 
331 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  34.22 
 
 
331 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  35.03 
 
 
332 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  32.89 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  32.56 
 
 
345 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  32.04 
 
 
330 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  29.31 
 
 
332 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.03 
 
 
335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  28.08 
 
 
332 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  30.34 
 
 
335 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  28.72 
 
 
332 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  30.69 
 
 
335 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  28.28 
 
 
332 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  28.52 
 
 
335 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  30.34 
 
 
335 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  32.26 
 
 
303 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  27.64 
 
 
506 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  27.64 
 
 
506 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  27.81 
 
 
507 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  28.96 
 
 
485 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  26.96 
 
 
527 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  27.1 
 
 
509 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  26.88 
 
 
512 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  26.17 
 
 
507 aa  89.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  26.02 
 
 
510 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  26.55 
 
 
510 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  26.65 
 
 
504 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  28.12 
 
 
511 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  28.12 
 
 
505 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  28.12 
 
 
511 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  28.12 
 
 
516 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  28.12 
 
 
511 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  28.12 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  26.18 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  25.55 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  25.31 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1236  Catalase  27.64 
 
 
483 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0619868  normal  0.69126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  25.99 
 
 
552 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  25.46 
 
 
554 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  28.13 
 
 
511 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  25.86 
 
 
517 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  26.54 
 
 
504 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  26.32 
 
 
501 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  26.48 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  25.71 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  25.39 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  26.23 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  28.06 
 
 
566 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  26.73 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  28.22 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  28.22 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  28.22 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  25.71 
 
 
503 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>