More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1580 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  100 
 
 
338 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  48.96 
 
 
353 aa  305  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  40.92 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  40.33 
 
 
365 aa  242  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  40.2 
 
 
335 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  39.2 
 
 
362 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  38.41 
 
 
363 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  38.31 
 
 
361 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  38.31 
 
 
361 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  38.31 
 
 
361 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  35.86 
 
 
361 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  38.24 
 
 
361 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  39.41 
 
 
364 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  36.01 
 
 
350 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  36.48 
 
 
348 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  37.74 
 
 
363 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  35.69 
 
 
350 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  37.74 
 
 
361 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  39.38 
 
 
363 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  39.38 
 
 
363 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  37.34 
 
 
361 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  37.34 
 
 
361 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  35.5 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  37.54 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  32.19 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  36.54 
 
 
370 aa  195  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  35.66 
 
 
365 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  35.66 
 
 
351 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  35.18 
 
 
366 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  35.96 
 
 
357 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  36.81 
 
 
368 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  35.44 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  33.89 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  33.01 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  35.2 
 
 
353 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  31.46 
 
 
331 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  34.44 
 
 
353 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  33.44 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  34.65 
 
 
353 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  33.77 
 
 
332 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  34.27 
 
 
329 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  34.9 
 
 
330 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  34.46 
 
 
330 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  33.89 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  32.1 
 
 
332 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  33.56 
 
 
330 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  32.24 
 
 
334 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  32.63 
 
 
326 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  31.6 
 
 
331 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  30.9 
 
 
329 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  31.55 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  32.13 
 
 
345 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  31.03 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  31.82 
 
 
332 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  29.08 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  31.47 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  31.96 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  31.83 
 
 
335 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  32.18 
 
 
335 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.83 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  31.83 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  28.82 
 
 
332 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  27.09 
 
 
510 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  28.52 
 
 
517 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  27.59 
 
 
504 aa  92.8  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  26.36 
 
 
491 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  27.67 
 
 
511 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  27.67 
 
 
511 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  27.67 
 
 
511 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  27.93 
 
 
567 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  28.18 
 
 
506 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  28.18 
 
 
506 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  25.08 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  26.69 
 
 
478 aa  86.7  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  26.27 
 
 
513 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  28.52 
 
 
724 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  27.48 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  28.03 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  27.12 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  27.59 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  26.9 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  26.1 
 
 
501 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  26.19 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1236  Catalase  27.91 
 
 
483 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0619868  normal  0.69126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  25.66 
 
 
459 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  25.66 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  25.66 
 
 
459 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  27.36 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  26.82 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  26.07 
 
 
481 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  26.51 
 
 
510 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  25.83 
 
 
493 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  25.68 
 
 
713 aa  82.8  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  27.4 
 
 
848 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  27.3 
 
 
684 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  26.69 
 
 
488 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  27.63 
 
 
478 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  25.28 
 
 
459 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  26.12 
 
 
513 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  26.89 
 
 
507 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>