More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1668 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  100 
 
 
363 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  91.18 
 
 
362 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  57.1 
 
 
361 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  56.33 
 
 
363 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  56.33 
 
 
363 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  57.1 
 
 
361 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  57.1 
 
 
361 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  57.1 
 
 
361 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  55.59 
 
 
348 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  58.41 
 
 
363 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  55.84 
 
 
364 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  55.15 
 
 
361 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  54.85 
 
 
361 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  54.85 
 
 
361 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  55.17 
 
 
370 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  55.56 
 
 
350 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  56.19 
 
 
350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  54.05 
 
 
366 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  55.89 
 
 
350 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  53.45 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  53.07 
 
 
370 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  53.41 
 
 
372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  52.98 
 
 
364 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  48.64 
 
 
361 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  47.01 
 
 
367 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  49.39 
 
 
363 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  46.22 
 
 
368 aa  305  9.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  46.13 
 
 
353 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  48.12 
 
 
353 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  46.56 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  45.43 
 
 
365 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  45.57 
 
 
351 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  43.32 
 
 
335 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  40.72 
 
 
365 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  40.26 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  40.98 
 
 
353 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  36.06 
 
 
329 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  38.41 
 
 
338 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  37.12 
 
 
326 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  32.82 
 
 
331 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  37.08 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  38.33 
 
 
332 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  36.97 
 
 
329 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  37.23 
 
 
328 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  33.83 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  35.41 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  35.83 
 
 
331 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  35.97 
 
 
330 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  35.41 
 
 
330 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.55 
 
 
332 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  31.96 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  34.21 
 
 
334 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  31.09 
 
 
332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  31.38 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  31.91 
 
 
330 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  31.32 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  30.75 
 
 
335 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  30.03 
 
 
335 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  33.68 
 
 
332 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  30.46 
 
 
335 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  30.35 
 
 
335 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  32.88 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  34.15 
 
 
303 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  26.9 
 
 
527 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  25.08 
 
 
554 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  27.35 
 
 
509 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  26.62 
 
 
459 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  29.62 
 
 
513 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  25.71 
 
 
552 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  26.3 
 
 
459 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  26.58 
 
 
552 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  26.95 
 
 
458 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.86 
 
 
459 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.86 
 
 
459 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  28.93 
 
 
509 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  26.86 
 
 
459 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  26.86 
 
 
459 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  28.45 
 
 
512 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  26.45 
 
 
458 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  28.62 
 
 
516 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  28.62 
 
 
562 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  28.62 
 
 
511 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  28.62 
 
 
511 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  26.86 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  28.62 
 
 
511 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  28.62 
 
 
505 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  26.1 
 
 
503 aa  87  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  28.25 
 
 
499 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  26.41 
 
 
517 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  27.89 
 
 
487 aa  85.9  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  26.77 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  27.91 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  25.25 
 
 
529 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  28.31 
 
 
511 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  25.94 
 
 
504 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  25.51 
 
 
675 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  28.12 
 
 
507 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  27.81 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  27.81 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  27.81 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>