More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4983 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  91.18 
 
 		 363 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  100 
 
 		 362 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  57.26 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  57.26 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  56.98 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  56.98 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  56.63 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  55.76 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  57.28 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  56.63 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  56.96 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  56.96 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  57.32 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  54.76 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  56.78 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  57.1 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  55.76 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  53.31 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  55.15 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  54.85 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  53.78 
 
 		 370 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  53.03 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  51.64 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  47.37 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  51.21 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  47.15 
 
 		 367 aa  316  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  46.76 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  48.28 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  45.67 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  47.34 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  44.34 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  44.48 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  42.72 
 
 		 335 aa  262  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  40.54 
 
 		 365 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  43.09 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  40.73 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  37.99 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  39.2 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  32.62 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  36.24 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  37.25 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  36.47 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  35.67 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  35.8 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  34.75 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  34.87 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  34.77 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  32.43 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  34.21 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  32.74 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.76 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  31.36 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  32.15 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  32.62 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  33.33 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  31.78 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  31.79 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.5 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  31.5 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  29.71 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  33.33 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  32.34 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  31.58 
 
 		 303 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  26.33 
 
 		 527 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  27.18 
 
 		 458 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  27.35 
 
 		 512 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  27.18 
 
 		 459 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  25.32 
 
 		 517 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  23.42 
 
 		 554 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  24.32 
 
 		 529 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  26.3 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.54 
 
 		 459 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  26.54 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  26.54 
 
 		 459 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.54 
 
 		 459 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  27.5 
 
 		 499 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  24.55 
 
 		 552 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  24.32 
 
 		 529 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  26.69 
 
 		 487 aa  86.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  25.97 
 
 		 459 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  26.54 
 
 		 458 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  27.57 
 
 		 693 aa  85.9  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  26.18 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  25.58 
 
 		 675 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  24.85 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  28.28 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  25.71 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  25.08 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  26.76 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  26.56 
 
 		 555 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  26.45 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  26.81 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  25.87 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  27.37 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  27.16 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  28.22 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  27.05 
 
 		 689 aa  80.5  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  26.65 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  26.65 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  26.65 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>