74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1771.2 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1771.2  catalase  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  87.03 
 
 		 335 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  86.61 
 
 		 335 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  86.61 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  86.19 
 
 		 335 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  81.36 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  82.61 
 
 		 332 aa  390  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  81.3 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  80.34 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  70.76 
 
 		 332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  65.81 
 
 		 330 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  31.3 
 
 		 332 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  29.39 
 
 		 353 aa  85.5  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  32.97 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  28.69 
 
 		 363 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  30.16 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  34.05 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  28.44 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  30.05 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  29.27 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  30.49 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  31.1 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  31.1 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  30.49 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  29.27 
 
 		 364 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  29.67 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  30.49 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  30.59 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  31.1 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  28.03 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  28.82 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  29.27 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  28.82 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  28.82 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  29.35 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  30 
 
 		 361 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  30 
 
 		 361 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  27.81 
 
 		 364 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  28.57 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  30.27 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  29.64 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  26.92 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  29.2 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  26.78 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  25.44 
 
 		 365 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  25.44 
 
 		 351 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  27.91 
 
 		 326 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  27.96 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  25.41 
 
 		 368 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  29.83 
 
 		 330 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  28.42 
 
 		 330 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  26.19 
 
 		 332 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  26.34 
 
 		 329 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  27.89 
 
 		 330 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  25.15 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  28.16 
 
 		 848 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  26.77 
 
 		 370 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  25.2 
 
 		 363 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  26.26 
 
 		 716 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  26.26 
 
 		 357 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  26.44 
 
 		 794 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  25.43 
 
 		 704 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  25 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  25.52 
 
 		 709 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  25.52 
 
 		 709 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  26.18 
 
 		 328 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  23.04 
 
 		 345 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  24.24 
 
 		 366 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  24.88 
 
 		 752 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  24.86 
 
 		 750 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  24.86 
 
 		 750 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  24.86 
 
 		 750 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  24.86 
 
 		 750 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  24.86 
 
 		 750 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>