278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0775 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  92.38 
 
 
212 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  83.17 
 
 
212 aa  362  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  81.73 
 
 
212 aa  357  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  81.25 
 
 
212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  81.25 
 
 
212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  81.25 
 
 
215 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  81.25 
 
 
212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  81.25 
 
 
212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  81.25 
 
 
212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  81.25 
 
 
212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  81.25 
 
 
212 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  80.29 
 
 
212 aa  353  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  67.94 
 
 
211 aa  301  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  67.94 
 
 
211 aa  301  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  66.03 
 
 
217 aa  294  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  66.51 
 
 
211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  60.49 
 
 
263 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  60.49 
 
 
263 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  64.68 
 
 
224 aa  266  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  61.76 
 
 
208 aa  261  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  62.87 
 
 
223 aa  259  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  60 
 
 
226 aa  245  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  55.22 
 
 
267 aa  235  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  57.22 
 
 
191 aa  224  7e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  42.29 
 
 
216 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  42.29 
 
 
216 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  41.79 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  41.79 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  41.79 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  41.79 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  41.79 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  41.79 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  42.29 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  41.29 
 
 
216 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  39.8 
 
 
216 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  39.27 
 
 
239 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  40 
 
 
271 aa  148  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  38.62 
 
 
277 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  39.06 
 
 
204 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  37.84 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  37.1 
 
 
274 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  36.46 
 
 
224 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  37.11 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  37.97 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  35.71 
 
 
313 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  37.17 
 
 
223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  36.92 
 
 
256 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  34.76 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  35.94 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  37.7 
 
 
249 aa  127  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  35.68 
 
 
247 aa  124  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  35.1 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  35.1 
 
 
246 aa  118  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  34.76 
 
 
229 aa  118  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  33.69 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  33.69 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  36.2 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  32.43 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  36.71 
 
 
208 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  29.5 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  32.63 
 
 
337 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  30 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  30.52 
 
 
353 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  34.71 
 
 
341 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  36.46 
 
 
388 aa  59.3  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.21 
 
 
716 aa  58.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  27.63 
 
 
329 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  28.93 
 
 
542 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1758  GTP diphosphokinase, RelA/SpoT protein  33.33 
 
 
722 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76617  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  27.78 
 
 
570 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.78 
 
 
705 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  29.78 
 
 
705 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.62 
 
 
750 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  27.27 
 
 
362 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  28.18 
 
 
272 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  26.74 
 
 
365 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.43 
 
 
747 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.21 
 
 
705 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4475  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.58 
 
 
751 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  27.57 
 
 
359 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 
744 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  31.97 
 
 
747 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  33.13 
 
 
1046 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  34.78 
 
 
722 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.14 
 
 
574 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1894  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.2 
 
 
753 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818102  hitchhiker  0.00061937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  30.67 
 
 
749 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1217  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.15 
 
 
746 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212214  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  34.48 
 
 
340 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  27.33 
 
 
366 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.33 
 
 
746 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  30.77 
 
 
373 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.33 
 
 
746 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.33 
 
 
746 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  32.5 
 
 
350 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000576608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  28.99 
 
 
747 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  24.04 
 
 
359 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2238  GTP diphosphokinase  31.67 
 
 
746 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338893  hitchhiker  0.000119577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  27.54 
 
 
577 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>