112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  453  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  44.66 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  41.12 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  33.5 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  35.27 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  34.76 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  36.32 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  35.58 
 
 		 246 aa  114  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  37.04 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  33.86 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  37.17 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  32.45 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  35.94 
 
 		 250 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  32.8 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  35.29 
 
 		 269 aa  111  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  33.86 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  33.86 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  33.87 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  33.86 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  33.86 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  33.86 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  37 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  33.86 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  33.01 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  33.01 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  33.86 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  35.64 
 
 		 274 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  30.41 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  33.49 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  36.54 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  34.34 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  34.17 
 
 		 247 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  31.61 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  31.93 
 
 		 261 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  34.78 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  34.18 
 
 		 191 aa  93.2  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  29.74 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  29.74 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  28.65 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  30.26 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  30.77 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  27.23 
 
 		 263 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  27.23 
 
 		 263 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  89  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  29.5 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  29 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  29.44 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  29.44 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  29.44 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  28.72 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  32 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  28.93 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  31.1 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  32.34 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  27.27 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  28.57 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  28.87 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  30.96 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  32.19 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  30.46 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  27.96 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  29.05 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  27.32 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  28.37 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  29.05 
 
 		 570 aa  55.5  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  26.58 
 
 		 542 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2071  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  29.56 
 
 		 751 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000208286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  26.49 
 
 		 353 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1530  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000286659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  30.37 
 
 		 705 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  28.65 
 
 		 1046 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.37 
 
 		 705 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  27.01 
 
 		 577 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.63 
 
 		 705 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0200  (p)ppGpp synthetase  29.7 
 
 		 739 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.546884  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3236  GDP/GTP pyrophosphokinase  29.11 
 
 		 743 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000465507  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2023  guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase  26.9 
 
 		 735 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.26 
 
 		 574 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1288  RelA/SpoT family protein  27.31 
 
 		 723 aa  45.4  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000178094  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1408  RelA/SpoT family protein  27.31 
 
 		 731 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  23.15 
 
 		 349 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0453  RelA/SpoT family protein  27.31 
 
 		 723 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000671385  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1361  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  25.71 
 
 		 703 aa  45.4  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.011666  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  26.38 
 
 		 745 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000459955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  26.95 
 
 		 350 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000576608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  24.03 
 
 		 373 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0376  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  26.29 
 
 		 743 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0815  GDP/GTP pyrophosphokinase  26.32 
 
 		 745 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5841  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.99 
 
 		 728 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.52 
 
 		 717 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>