59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0381 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  764    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  31.3 
 
 
369 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  31.29 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  33.16 
 
 
198 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  29.03 
 
 
1046 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  29.06 
 
 
366 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  28.96 
 
 
577 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  29.71 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  30.54 
 
 
574 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  31.33 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  31.33 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  28.79 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  27.14 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  29.35 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  28 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  28.71 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  32.39 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3545  RelA/SpoT  29.82 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.340124 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  30 
 
 
223 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  29.17 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  31.54 
 
 
212 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  28.41 
 
 
230 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  24.83 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  31.58 
 
 
212 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  29.32 
 
 
212 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07115  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
456 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010047  normal  0.501365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0671  RelA/SpoT domain protein  28.31 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  28.57 
 
 
215 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  29.46 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  29.46 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  27.82 
 
 
211 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  27.82 
 
 
211 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  28.19 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  28.68 
 
 
224 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  30.77 
 
 
210 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  26.07 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  24.41 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  26.11 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  26.17 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  29.01 
 
 
217 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  26.28 
 
 
226 aa  47  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  23.38 
 
 
191 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  24.69 
 
 
216 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  23.46 
 
 
216 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  25.49 
 
 
542 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  24.07 
 
 
216 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  27.61 
 
 
208 aa  43.5  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  28.93 
 
 
290 aa  43.1  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  24.03 
 
 
221 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  27.64 
 
 
246 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  32.63 
 
 
233 aa  42.7  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>