More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0678 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  100 
 
 
191 aa  391  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  65.96 
 
 
217 aa  268  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  57.98 
 
 
208 aa  229  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  57.22 
 
 
210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  56.61 
 
 
223 aa  223  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  57.75 
 
 
212 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  56.91 
 
 
212 aa  222  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  56.91 
 
 
212 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  56.91 
 
 
212 aa  221  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  56.91 
 
 
212 aa  221  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  56.91 
 
 
212 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  56.91 
 
 
215 aa  221  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  56.91 
 
 
212 aa  221  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  56.91 
 
 
212 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  56.91 
 
 
212 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  56.91 
 
 
212 aa  221  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  56.38 
 
 
212 aa  218  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  54.55 
 
 
211 aa  218  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  54.55 
 
 
211 aa  218  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  55.56 
 
 
224 aa  216  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  51.6 
 
 
263 aa  210  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  51.6 
 
 
263 aa  210  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  53.44 
 
 
226 aa  206  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  53.48 
 
 
211 aa  201  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  44.68 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  36.51 
 
 
216 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  36.51 
 
 
216 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  36.51 
 
 
216 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  36.51 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  36.51 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  36.51 
 
 
216 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  36.51 
 
 
216 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  38.71 
 
 
256 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  35.98 
 
 
216 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  35.98 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  35.98 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  36.32 
 
 
247 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  35.45 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  32.62 
 
 
313 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  36.72 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  36.16 
 
 
269 aa  125  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  40.94 
 
 
249 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  35.48 
 
 
290 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  36.02 
 
 
239 aa  121  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  34.41 
 
 
250 aa  121  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  35.9 
 
 
261 aa  118  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  36.31 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  34.39 
 
 
271 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  33.16 
 
 
204 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  36.42 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  34.95 
 
 
230 aa  111  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  33.14 
 
 
203 aa  108  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  32.96 
 
 
277 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  34.86 
 
 
246 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  33.74 
 
 
208 aa  101  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  34.69 
 
 
229 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  31.43 
 
 
223 aa  98.6  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  27.75 
 
 
233 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  29.32 
 
 
230 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  29.32 
 
 
230 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  34.18 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  30.71 
 
 
362 aa  62  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  27.67 
 
 
337 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  30.77 
 
 
577 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  32.5 
 
 
574 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.67 
 
 
716 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.34 
 
 
750 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  31.82 
 
 
388 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  25.91 
 
 
570 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  25.93 
 
 
268 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  25.93 
 
 
268 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1920  GTP pyrophosphokinase  34.53 
 
 
718 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.682982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  27.01 
 
 
365 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0095  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  33.6 
 
 
745 aa  54.7  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000291848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  30.97 
 
 
381 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  29.85 
 
 
353 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2029  GTP pyrophosphokinase  34.68 
 
 
738 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178935  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  33.33 
 
 
1046 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 
747 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4220  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
760 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  27.43 
 
 
359 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.37 
 
 
740 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  27.27 
 
 
362 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3236  GDP/GTP pyrophosphokinase  36.22 
 
 
743 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000465507  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  30.61 
 
 
368 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3527  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28 
 
 
701 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982777  normal  0.148068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2518  GTP pyrophosphokinase  32.54 
 
 
745 aa  52  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.326663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002504  GTP pyrophosphokinase (p)ppGpp synthetase I  34.68 
 
 
739 aa  51.6  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000545051  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.91 
 
 
705 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03528  GTP pyrophosphokinase  36.11 
 
 
739 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1033  GTP diphosphokinase  34.96 
 
 
734 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0165822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3097  GDP/GTP pyrophosphokinase  36.11 
 
 
744 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000040075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3276  GDP/GTP pyrophosphokinase  35.48 
 
 
744 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00140611  normal  0.0304818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3178  GDP/GTP pyrophosphokinase  35.48 
 
 
744 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00141228  normal  0.185279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  33.04 
 
 
705 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3115  GDP/GTP pyrophosphokinase  36.11 
 
 
744 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0106723  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  30.6 
 
 
484 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3162  GDP/GTP pyrophosphokinase  35.48 
 
 
744 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00447218  normal  0.0412564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1111  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.87 
 
 
735 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000170035  normal  0.84646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1177  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.87 
 
 
735 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000122235  normal  0.0382614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>