86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2070 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  100 
 
 		 329 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  35.17 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3545  RelA/SpoT  42 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.340124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0671  RelA/SpoT domain protein  32.33 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  34.24 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  31.41 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  28.71 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  30.1 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  28.67 
 
 		 1046 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  27.91 
 
 		 574 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  29.34 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  31.03 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  28.39 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  26.8 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  27.63 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  27.08 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  29.61 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  27.08 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  35.48 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  25.45 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  25.45 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  28.67 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  25.58 
 
 		 577 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  28.37 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  29.19 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  27.97 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  25.56 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  31.15 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  27.88 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  28.66 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  28.66 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  27.27 
 
 		 212 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  32.14 
 
 		 812 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  26.45 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  28.57 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  23.28 
 
 		 368 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  27.1 
 
 		 268 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  27.1 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1423  RelA/SpoT domain-containing protein  28.28 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320561  normal  0.653719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.81 
 
 		 827 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  0.00000728185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  31.5 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  26.59 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  29.19 
 
 		 815 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  31.25 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  29.24 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  29.1 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  27.05 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  26.51 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  29.85 
 
 		 216 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0704  GTP diphosphokinase  29.44 
 
 		 783 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  25 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  27.67 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  29.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  29.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  29.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  29.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  29.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  29.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  23.98 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  29.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  27.27 
 
 		 790 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000342988  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  29.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.11 
 
 		 801 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  30.83 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2308  RelA/SpoT family protein  28.67 
 
 		 790 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0636363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  30.83 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.11 
 
 		 806 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.11 
 
 		 801 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  27.81 
 
 		 191 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.56 
 
 		 727 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.97 
 
 		 788 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.31 
 
 		 766 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.82 
 
 		 725 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.17 
 
 		 710 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  31.82 
 
 		 233 aa  43.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  27.67 
 
 		 759 aa  42.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0308  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  29.05 
 
 		 774 aa  42.7  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00325244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0947  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.37 
 
 		 721 aa  42.4  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.452547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3812  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.97 
 
 		 790 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.41 
 
 		 797 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>