252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0586 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  100 
 
 		 211 aa  436  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  91.94 
 
 		 211 aa  404  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  91.94 
 
 		 211 aa  404  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  68.1 
 
 		 212 aa  309  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  66.51 
 
 		 210 aa  300  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  65.38 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  63.94 
 
 		 212 aa  288  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  63.46 
 
 		 215 aa  287  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  63.46 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  63.46 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  63.46 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  63.46 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  63.46 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  63.46 
 
 		 212 aa  286  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  63.46 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  63.46 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  60.1 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  62.56 
 
 		 263 aa  268  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  62.56 
 
 		 263 aa  268  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  61.24 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  61.93 
 
 		 224 aa  259  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  58.38 
 
 		 223 aa  247  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  57.75 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  53.03 
 
 		 267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  53.48 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  38.73 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  38.73 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  38.73 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  38.73 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  38.73 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  40 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  40 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  39.22 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  39.22 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  39.22 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  38.73 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  39.58 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  37.62 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  40.33 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  37.76 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  39.25 
 
 		 274 aa  144  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  36.92 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  36.54 
 
 		 261 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  38.02 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  36.6 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  35.57 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  41.53 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  37.97 
 
 		 290 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  35.26 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  36.65 
 
 		 256 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  36.65 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  37.91 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  35.29 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  33.16 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  33.16 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  32.11 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  36.54 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  33.33 
 
 		 247 aa  115  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  32.93 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  34.34 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  30.65 
 
 		 337 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  34.88 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  28.03 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  28.48 
 
 		 577 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.48 
 
 		 574 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  26.35 
 
 		 329 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  29.7 
 
 		 1046 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  25.41 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  26.34 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  30.77 
 
 		 366 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.64 
 
 		 716 aa  56.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  27.75 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  26.79 
 
 		 570 aa  55.5  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1808  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase  26.74 
 
 		 762 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  28.93 
 
 		 542 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  31.15 
 
 		 744 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0343  putative RelA/SpoT family protein  33.04 
 
 		 846 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.5 
 
 		 750 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0377  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.04 
 
 		 846 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  24.6 
 
 		 359 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  23.3 
 
 		 359 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  32.52 
 
 		 749 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  31.15 
 
 		 747 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  27.67 
 
 		 353 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.33 
 
 		 747 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  28.46 
 
 		 373 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  33.59 
 
 		 340 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1217  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.33 
 
 		 746 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.51 
 
 		 746 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.51 
 
 		 746 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  29.75 
 
 		 341 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2238  GTP diphosphokinase  33.33 
 
 		 746 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338893  hitchhiker  0.000119577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.51 
 
 		 746 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1462  GTP pyrophosphokinase  31.01 
 
 		 714 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00122903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  29.51 
 
 		 747 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1533  RelA/SpoT family protein  31.01 
 
 		 714 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000577209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0496  RelA/SpoT family protein  30.87 
 
 		 754 aa  50.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2703  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.26 
 
 		 750 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157832  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52180  GTP pyrophosphokinase  29.51 
 
 		 747 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00224344  normal  0.0200902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>