292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1423 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  84.09 
 
 
223 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  66.67 
 
 
217 aa  281  8.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  67.5 
 
 
226 aa  275  6e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  66.34 
 
 
212 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  63.37 
 
 
212 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  62.56 
 
 
212 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  62.09 
 
 
212 aa  268  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  62.09 
 
 
212 aa  267  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  62.09 
 
 
212 aa  267  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  62.09 
 
 
212 aa  267  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  62.09 
 
 
215 aa  267  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  62.09 
 
 
212 aa  267  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  62.09 
 
 
212 aa  267  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  62.09 
 
 
212 aa  267  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  62.09 
 
 
212 aa  267  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  64.68 
 
 
210 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  58.79 
 
 
263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  58.79 
 
 
263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  61.42 
 
 
211 aa  254  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  61.42 
 
 
211 aa  254  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  59.6 
 
 
208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  61.93 
 
 
211 aa  246  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  50.95 
 
 
267 aa  222  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  55.56 
 
 
191 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  40.59 
 
 
216 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  40.59 
 
 
216 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  42.19 
 
 
216 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  41.67 
 
 
216 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  41.67 
 
 
216 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  41.67 
 
 
216 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  41.67 
 
 
216 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  41.67 
 
 
216 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  39.32 
 
 
216 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  40.62 
 
 
216 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  40.62 
 
 
216 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  37.76 
 
 
313 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  37.56 
 
 
239 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  37.44 
 
 
290 aa  138  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  36.27 
 
 
250 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  38.17 
 
 
274 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  38.51 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  36.36 
 
 
247 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  38.62 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  35.29 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  36.1 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  37.16 
 
 
249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  34.95 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  34.22 
 
 
230 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  34.76 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  34.38 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  33.68 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  37.18 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  35.79 
 
 
246 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  34.9 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  32.43 
 
 
233 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  34.74 
 
 
230 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  34.74 
 
 
230 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  35 
 
 
203 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  35.62 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  32 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  30.46 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  31.14 
 
 
1046 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  28.39 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0343  putative RelA/SpoT family protein  35.54 
 
 
846 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000094604  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0377  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  35.54 
 
 
846 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2636  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.76 
 
 
748 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 
727 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  28.74 
 
 
577 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0645  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  34.53 
 
 
750 aa  55.1  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  29.92 
 
 
388 aa  55.1  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0383  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.29 
 
 
897 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000110921  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_004310  BR0652  RelA/SpoT family protein  34.53 
 
 
750 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3527  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.58 
 
 
701 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982777  normal  0.148068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2442  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.14 
 
 
730 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.224797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4475  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.8 
 
 
751 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15280  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  33.33 
 
 
740 aa  52.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0308  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  32.26 
 
 
774 aa  52.4  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00325244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  26.72 
 
 
365 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0496  RelA/SpoT family protein  27.52 
 
 
754 aa  52.4  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1856  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  28.8 
 
 
715 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.709628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.4 
 
 
722 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  29.01 
 
 
366 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  28.65 
 
 
369 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  26.72 
 
 
362 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  29.01 
 
 
749 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  29.79 
 
 
716 aa  51.6  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  31.45 
 
 
744 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl278  guanosine-3', 5'-bis(diphosphate)3'-pyrophosphohydrolase  27.07 
 
 
765 aa  51.2  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00637437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.58 
 
 
705 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  31.45 
 
 
747 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  30.58 
 
 
705 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  36.28 
 
 
353 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.11 
 
 
781 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  28.68 
 
 
373 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2868  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.23 
 
 
719 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706713  normal  0.0333863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.23 
 
 
705 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  32.79 
 
 
759 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17580  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  32.61 
 
 
775 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.091974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>