More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0971 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4829  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.49 
 
 		 749 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  50.41 
 
 		 726 aa  725    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000567155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0709  GTP diphosphokinase  46.5 
 
 		 727 aa  682    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.348241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3211  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.34 
 
 		 716 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00108978  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  44.41 
 
 		 728 aa  651    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2236  GTP pyrophosphokinase  45.17 
 
 		 716 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.06 
 
 		 716 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.83 
 
 		 710 aa  712    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1801  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.24 
 
 		 795 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.203828  normal  0.0273265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1288  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.77 
 
 		 729 aa  715    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0314087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4491  GTP pyrophosphokinase  46.5 
 
 		 727 aa  680    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  44.21 
 
 		 856 aa  671    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4122  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.13 
 
 		 774 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4487  GTP diphosphokinase  46.36 
 
 		 727 aa  678    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000280159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4302  GTP pyrophosphokinase  46.23 
 
 		 727 aa  678    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4140  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  46.36 
 
 		 727 aa  679    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4151  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  46.64 
 
 		 727 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0733  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.88 
 
 		 721 aa  716    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000178164  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17580  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  42.78 
 
 		 775 aa  651    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.091974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2572  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.46 
 
 		 748 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2284  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.05 
 
 		 716 aa  641    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0529541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  45.51 
 
 		 814 aa  658    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.06 
 
 		 714 aa  671    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.27 
 
 		 827 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  0.00000728185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4526  GTP diphosphokinase  46.5 
 
 		 727 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1433  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.89 
 
 		 743 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.37 
 
 		 725 aa  724    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4989  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  46.52 
 
 		 751 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3380  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43 
 
 		 822 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200325  hitchhiker  0.00033219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12190  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  50.28 
 
 		 716 aa  725    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000855141  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  44.41 
 
 		 728 aa  650    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2116  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.06 
 
 		 807 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0339196  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0005  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.82 
 
 		 728 aa  651    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0939  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.99 
 
 		 732 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1344  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.95 
 
 		 724 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000566061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  42.49 
 
 		 786 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2325  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.8 
 
 		 716 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000013827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21900  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  42.62 
 
 		 789 aa  640    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2720  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.8 
 
 		 802 aa  650    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4637  GTP pyrophosphokinase  46.23 
 
 		 727 aa  678    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1377  metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 		 779 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.790837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  48.76 
 
 		 717 aa  725    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1213  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.59 
 
 		 756 aa  684    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.167676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  42.86 
 
 		 809 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.698973  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  43.27 
 
 		 815 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1219  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.26 
 
 		 771 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0947  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.43 
 
 		 721 aa  648    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.452547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.82 
 
 		 726 aa  696    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0548  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.06 
 
 		 813 aa  656    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3042  (p)ppGpp synthetase I  46.2 
 
 		 758 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1724  GTP pyrophosphokinase  45.58 
 
 		 729 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.84 
 
 		 721 aa  663    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  44.6 
 
 		 812 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.34 
 
 		 742 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2193  GTP pyrophosphokinase  47.49 
 
 		 726 aa  711    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1904  GTP pyrophosphokinase  47.64 
 
 		 726 aa  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1691  GTP pyrophosphokinase  45.58 
 
 		 729 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.599497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0901  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.22 
 
 		 712 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0988529  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2653  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.05 
 
 		 750 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3171  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.65 
 
 		 861 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1459  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.89 
 
 		 743 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  100 
 
 		 727 aa  1472    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.59 
 
 		 732 aa  709    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  48.6 
 
 		 734 aa  708    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2287  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.56 
 
 		 727 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421652  hitchhiker  0.000000120051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3609  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.5 
 
 		 726 aa  716    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3123  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.78 
 
 		 727 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00942759  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.26 
 
 		 804 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0857  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  42.8 
 
 		 750 aa  638    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.9 
 
 		 781 aa  658    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.95 
 
 		 797 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.48 
 
 		 766 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.17 
 
 		 820 aa  675    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2399  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.72 
 
 		 717 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.088294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4254  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.34 
 
 		 727 aa  684    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00950275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4541  GTP diphosphokinase  46.36 
 
 		 727 aa  678    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3160  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.35 
 
 		 716 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000534468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.73 
 
 		 806 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0885  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.52 
 
 		 733 aa  634  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3821  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.69 
 
 		 787 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.438652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.72 
 
 		 793 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.73 
 
 		 801 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1999  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.29 
 
 		 790 aa  634  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.73 
 
 		 801 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6106  GTP diphosphokinase  41.84 
 
 		 785 aa  631  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364718  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0616  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.37 
 
 		 713 aa  631  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000184713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.74 
 
 		 745 aa  630  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000459955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2392  RelA/SpoT family protein  42.84 
 
 		 743 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997464  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1536  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.86 
 
 		 719 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.11 
 
 		 781 aa  628  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0839645  hitchhiker  0.0000697847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2027  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.38 
 
 		 763 aa  626  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174552 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  44.05 
 
 		 748 aa  623  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.92 
 
 		 788 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1196  GTP pyrophosphokinase  44.07 
 
 		 729 aa  619  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0487271  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0193  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  44.43 
 
 		 769 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  40.54 
 
 		 759 aa  620  1e-176  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02201  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  43.6 
 
 		 769 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28061  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase, (ppGpp)ase  43.18 
 
 		 753 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.871091 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0910  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.24 
 
 		 726 aa  617  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.746196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2057  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.47 
 
 		 716 aa  618  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>