93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4146 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  696    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  30.97 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  35.21 
 
 		 356 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  35.21 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  33.51 
 
 		 198 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  26.26 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  35.2 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  25.71 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  34.74 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  33.33 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  31.96 
 
 		 267 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  31.15 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  32.69 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  33.75 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  28.08 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  28.93 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  32.63 
 
 		 210 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  25.83 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  31.05 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  31.05 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  28.93 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  29.44 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  29.57 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  29.57 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  22.86 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  28.85 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  34.75 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  29.94 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  31.18 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  36.43 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  36.43 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  29.21 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  33.57 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  29.35 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  33.08 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  27.85 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  27.85 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  30.82 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  28.48 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  30.14 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  30.82 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  29.45 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  29.45 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  28.3 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  33.09 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  29.45 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  27.11 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  31.43 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  31.43 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  30.71 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  30.71 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  34.07 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  32.32 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  27.03 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  32.34 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  23.36 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  31.65 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  30.77 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  26.67 
 
 		 1046 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  31.54 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  27.67 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  26.88 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  28.41 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  29.19 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  35.48 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07115  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 		 456 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010047  normal  0.501365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  30 
 
 		 570 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  27.33 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  21.62 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3545  RelA/SpoT  27.81 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.340124 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  26.74 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  25 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  26.83 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  24.6 
 
 		 513 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  25.32 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  25.32 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  28.95 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1533  RelA/SpoT family protein  29.38 
 
 		 714 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000577209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  24.06 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1462  GTP pyrophosphokinase  28.75 
 
 		 714 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00122903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>