54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0181 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  88.28 
 
 
368 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 
368 aa  755    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  30.61 
 
 
1046 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  31.35 
 
 
577 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  30.41 
 
 
574 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  28.32 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  24.02 
 
 
484 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  23.19 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  28.87 
 
 
221 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  28 
 
 
208 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  24.66 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  21.7 
 
 
365 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  27.14 
 
 
356 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  21.97 
 
 
362 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  26.79 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  25.79 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0671  RelA/SpoT domain protein  23.53 
 
 
329 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  30.12 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  30.12 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  30.61 
 
 
191 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  21.96 
 
 
337 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  26.45 
 
 
329 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  28.28 
 
 
203 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  21.78 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  26.09 
 
 
263 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  26.09 
 
 
263 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  26.07 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  30.25 
 
 
208 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  23.72 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  23.56 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  26.76 
 
 
542 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  21.65 
 
 
495 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  20.87 
 
 
513 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  25.37 
 
 
212 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3545  RelA/SpoT  27.92 
 
 
328 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.340124 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  24.57 
 
 
217 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  25.85 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  25.85 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  25.85 
 
 
215 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  25.85 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  25.85 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  25.85 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  25.85 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  25.85 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  25 
 
 
269 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  28.38 
 
 
212 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  24.88 
 
 
212 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  24.34 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  25.96 
 
 
223 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  27.71 
 
 
211 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1530  hypothetical protein  23.41 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000286659 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  24.86 
 
 
246 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  28.17 
 
 
239 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  25.85 
 
 
210 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>