42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  980    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  29.64 
 
 
577 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  27.66 
 
 
574 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  27.91 
 
 
1046 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  32.04 
 
 
362 aa  63.9  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  28.49 
 
 
267 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  23.7 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  23.05 
 
 
368 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  29.61 
 
 
198 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  24.83 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  28.71 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  28.71 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  28.71 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  28.71 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  28.71 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  25.63 
 
 
208 aa  52.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  28.71 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  28.71 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  28.71 
 
 
215 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  28.71 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  29.44 
 
 
212 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  30.6 
 
 
191 aa  50.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  28.43 
 
 
212 aa  50.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  25.57 
 
 
342 aa  50.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  29.79 
 
 
224 aa  50.4  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  27.86 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  26.89 
 
 
369 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  29.28 
 
 
212 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  23.96 
 
 
246 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  29.41 
 
 
210 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  25.7 
 
 
269 aa  48.5  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  26.83 
 
 
337 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  29.61 
 
 
216 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  29.61 
 
 
216 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  28.65 
 
 
211 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  28.65 
 
 
211 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  28.47 
 
 
217 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  26.03 
 
 
203 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1530  hypothetical protein  26.32 
 
 
296 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000286659 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  29.79 
 
 
223 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  28.98 
 
 
263 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  28.98 
 
 
263 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>