199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1108 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  98.58 
 
 
212 aa  434  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  98.11 
 
 
215 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  98.11 
 
 
212 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  93.4 
 
 
212 aa  417  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  80.29 
 
 
210 aa  353  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  79.33 
 
 
212 aa  350  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  66.35 
 
 
211 aa  295  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  66.35 
 
 
211 aa  295  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  66.67 
 
 
217 aa  290  9e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  63.46 
 
 
211 aa  275  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  62.09 
 
 
224 aa  268  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  59.31 
 
 
263 aa  263  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  59.31 
 
 
263 aa  263  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  62.69 
 
 
223 aa  262  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  58.62 
 
 
208 aa  254  6e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  59.22 
 
 
226 aa  243  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  53.03 
 
 
267 aa  224  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  56.38 
 
 
191 aa  218  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  40.82 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  40.82 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  40.82 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.31 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  40.31 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  40.31 
 
 
216 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.31 
 
 
216 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  40.31 
 
 
216 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  39.8 
 
 
216 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  40.31 
 
 
216 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  39.29 
 
 
216 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  38.58 
 
 
239 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  39.78 
 
 
250 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  38.71 
 
 
274 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  35.75 
 
 
313 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  36.87 
 
 
290 aa  141  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  38.42 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  37.63 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  37.3 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  37.04 
 
 
277 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  36.98 
 
 
204 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  34.33 
 
 
230 aa  135  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  36.13 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  36.18 
 
 
261 aa  131  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  38.8 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  35.83 
 
 
256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  37.09 
 
 
269 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  33.51 
 
 
246 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  37.75 
 
 
229 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  31.58 
 
 
247 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  32.62 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  32.62 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  32.11 
 
 
233 aa  111  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  34.3 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  34.32 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  28.72 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  30.82 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  34.51 
 
 
353 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  26.86 
 
 
362 aa  62.4  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  34.19 
 
 
341 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  28.92 
 
 
362 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  32.76 
 
 
381 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  29.81 
 
 
542 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  29.63 
 
 
365 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  32.28 
 
 
1046 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  26.52 
 
 
359 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  27.97 
 
 
329 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  29.27 
 
 
716 aa  55.1  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  28.78 
 
 
359 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  34 
 
 
388 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  29.32 
 
 
373 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.89 
 
 
574 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  27.85 
 
 
570 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  25.26 
 
 
356 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  25.26 
 
 
356 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  27.67 
 
 
349 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  29.44 
 
 
484 aa  52  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  27.01 
 
 
366 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  28 
 
 
272 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  25.49 
 
 
495 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30 
 
 
705 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  30.3 
 
 
340 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  29.17 
 
 
705 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  31.58 
 
 
369 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.17 
 
 
705 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1808  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase  27.81 
 
 
762 aa  49.3  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1856  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  25.36 
 
 
715 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.709628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4475  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.45 
 
 
751 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 
577 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1204  RelA/SpoT family protein  28.78 
 
 
735 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.442977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0412  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.91 
 
 
733 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.563728  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  25.49 
 
 
513 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  28.57 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  31.52 
 
 
350 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000576608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0840  RelA/SpoT  25 
 
 
423 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000281443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>