202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1711 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 388 aa  787    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  31.15 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  32.12 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  36.03 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  36.03 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  36.03 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  33.33 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  34.62 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  30 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  31.76 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  27.07 
 
 		 570 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  37.69 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  33.85 
 
 		 574 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  28.95 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  33.85 
 
 		 577 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  31.1 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  35.79 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  36.46 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  38.78 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  33.33 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  38.78 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  34.4 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  36.46 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  33.86 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  38.78 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  38.78 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  34.88 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  38.54 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  34.88 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  38.54 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  36.08 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  38.78 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  38.78 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  38.78 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  32.39 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  35.42 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  33.09 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  34.13 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  28.92 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  30.23 
 
 		 271 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  34.68 
 
 		 224 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  36.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  34.4 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  37.23 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  36.17 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  36.46 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  31.45 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  34.15 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  32.41 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  31.03 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  30.23 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  31.91 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  32.43 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  29.28 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  29.63 
 
 		 269 aa  57  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  27.59 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  32.84 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  32.84 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  31.82 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  24.8 
 
 		 1046 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  34.88 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  28.36 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  35 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3545  RelA/SpoT  30.38 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.340124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  28.36 
 
 		 268 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 804 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  29.93 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  32.98 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  29.92 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  32.61 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 189 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1276 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  34 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  33.86 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 617 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 4079 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  34.17 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.7 
 
 		 746 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  34 
 
 		 212 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  29.03 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.37 
 
 		 1979 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.78 
 
 		 758 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  30.51 
 
 		 743 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 632 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 		 818 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  34.62 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  27.75 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 602 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>