More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3227 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  53.77 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  53.77 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  58.55 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  52.06 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  51.55 
 
 		 269 aa  210  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  52.66 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  47.06 
 
 		 247 aa  194  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  46.24 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  42.29 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  41.33 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  45.92 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  43.81 
 
 		 274 aa  188  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  43.22 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  40.27 
 
 		 271 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  46.32 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  44.04 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  44.86 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  41.98 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  42.25 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  40.89 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  40.21 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.74 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.74 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  40.74 
 
 		 216 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  37.26 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  37.37 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  35.83 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  34.16 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  34.16 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  34.16 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  34.16 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  34.16 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  34.16 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  34.16 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  34.16 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  34.74 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  35.9 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  34.74 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  34.16 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  35.32 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  34.33 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  38.62 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  34.76 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  35.83 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  34.76 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  34.76 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  36.02 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  35.26 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  34.22 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  35.29 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  34.76 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  35.8 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  34.95 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.08 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  26.99 
 
 		 362 aa  71.6  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  28.89 
 
 		 366 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  30.1 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  26.01 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.12 
 
 		 705 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  33.12 
 
 		 705 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  35.71 
 
 		 722 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  26.04 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.47 
 
 		 705 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  24.28 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  26.13 
 
 		 570 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  25.44 
 
 		 356 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  24.71 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  26.49 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.88 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  30.23 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1920  GTP pyrophosphokinase  36.59 
 
 		 718 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.682982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  28.27 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.88 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.88 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_002950  PG1530  hypothetical protein  26.02 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000286659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1217  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.11 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  23.53 
 
 		 495 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1361  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.88 
 
 		 703 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.011666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0731  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.71 
 
 		 769 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.583794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.6 
 
 		 716 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.51 
 
 		 740 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2113  GTP diphosphokinase  35.83 
 
 		 770 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.978919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2071  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  36.11 
 
 		 751 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000208286  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  31.82 
 
 		 714 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  34.44 
 
 		 747 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.77 
 
 		 747 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  34.44 
 
 		 744 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.11 
 
 		 736 aa  55.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  28.18 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  23.53 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  26.79 
 
 		 574 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  34.92 
 
 		 749 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>