89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1399 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 		 365 aa  759    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  90.03 
 
 		 362 aa  679    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  68.18 
 
 		 359 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  47.56 
 
 		 356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  47.85 
 
 		 356 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  46.63 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  45.56 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  25.71 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  33.72 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  26.85 
 
 		 574 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  28.7 
 
 		 1046 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  36.03 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  27.72 
 
 		 577 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  26.46 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  27.14 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  28.05 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  23.92 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  32.33 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  28.9 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  28.9 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  24.71 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  27.47 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  28 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  21.56 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.57 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.57 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  29.63 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  26.34 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  29.63 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  26.34 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  28.02 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  27.33 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  30.26 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  27.16 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  31.82 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  29.63 
 
 		 212 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  29.09 
 
 		 208 aa  57  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  27.96 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  27.88 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  28.06 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  31.97 
 
 		 246 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  26.95 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  29.55 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  28.49 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  25.95 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  26.6 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  26.74 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  27.01 
 
 		 191 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  27.43 
 
 		 247 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  30.59 
 
 		 217 aa  53.1  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  26.72 
 
 		 224 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  29.55 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  25.85 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  25.4 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  27.33 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  27.33 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  28.57 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  24.62 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  27.86 
 
 		 274 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  21.56 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000121431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0671  RelA/SpoT domain protein  27.53 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  21.56 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000143095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  24.14 
 
 		 239 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  28.16 
 
 		 542 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  25.26 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  23.64 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  24.76 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  25.38 
 
 		 223 aa  46.6  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  23.63 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.3269600000000002e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  25.66 
 
 		 204 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  24.81 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1423  RelA/SpoT domain-containing protein  23.03 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320561  normal  0.653719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  25.64 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1682  hypothetical protein  27.43 
 
 		 495 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.918456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  23.95 
 
 		 250 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>