22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3545 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3545  RelA/SpoT  100 
 
 		 328 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.340124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00111  RelA/SpoT  35.89 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.925333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0671  RelA/SpoT domain protein  35.35 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  42 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  35.22 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0381  hypothetical protein  29.82 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0160658  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  38.18 
 
 		 1046 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1831  RelA/SpoT domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  27.4 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  27.44 
 
 		 574 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  30.38 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  34.31 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  30.87 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  30.87 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  27.81 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  27.91 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  27.92 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  27.7 
 
 		 366 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  27.27 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  26.38 
 
 		 759 aa  43.1  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  31.07 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  25.98 
 
 		 267 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>