47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1530 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1530  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  608  1e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000286659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  30.19 
 
 
362 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  26.02 
 
 
230 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  29.7 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  26.26 
 
 
229 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  26.49 
 
 
269 aa  52  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4620  RelA/SpoT domain-containing protein  24.08 
 
 
1046 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  28.47 
 
 
256 aa  49.7  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  26.03 
 
 
577 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  25.33 
 
 
574 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  23.76 
 
 
233 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  25.9 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  29.1 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07115  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 
456 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010047  normal  0.501365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  29.71 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  24 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  24 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  21.86 
 
 
368 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  24.36 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  27.46 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  29.29 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02710  hypothetical protein  26.32 
 
 
484 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  29.41 
 
 
212 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  27.61 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  27.46 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0181  RelA/SpoT domain protein  23.5 
 
 
368 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  27.46 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  25.45 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  28.99 
 
 
212 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  27.89 
 
 
216 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  26.76 
 
 
216 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  26.76 
 
 
216 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1417  hypothetical protein  27.21 
 
 
513 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.753374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  28.06 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  28.06 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  28.06 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  28.06 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  28.06 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  28.06 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  29.03 
 
 
224 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  28.06 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  28.06 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  26.04 
 
 
570 aa  42.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  27.85 
 
 
212 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  29.17 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  26.87 
 
 
216 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>