123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0452 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 
350 aa  725    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000576608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  48.17 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  31.56 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  31.93 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  26.09 
 
 
381 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0840  RelA/SpoT  25.87 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000281443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1321  RelA/SpoT domain-containing protein  25.87 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000180036  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  34.11 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.23 
 
 
705 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  32.5 
 
 
210 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  29.41 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  26.6 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  31.4 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  28.08 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.57 
 
 
216 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  30.77 
 
 
226 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  28.48 
 
 
212 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  27.73 
 
 
216 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  29.23 
 
 
208 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  27.73 
 
 
216 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0815  GDP/GTP pyrophosphokinase  27.67 
 
 
745 aa  49.3  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  27.73 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3149  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.09 
 
 
747 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439153  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  27.73 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  27.73 
 
 
216 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  27.73 
 
 
216 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2496  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.09 
 
 
747 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  30.83 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  30.82 
 
 
223 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  30.83 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  30.83 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  30.83 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  30.83 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  29.51 
 
 
722 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2565  metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
710 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00145552  hitchhiker  0.00000902572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  31.93 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  29.91 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  29.91 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  30.58 
 
 
714 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  30.83 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  30.83 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  30.83 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  30.83 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  30.17 
 
 
705 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2071  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.58 
 
 
751 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000208286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.17 
 
 
705 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  31.03 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.17 
 
 
705 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  31.52 
 
 
212 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  30.95 
 
 
191 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11397  hypothetical protein  25.11 
 
 
273 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1576  GTP pyrophosphokinase  31.15 
 
 
746 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.46 
 
 
746 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  25.66 
 
 
224 aa  46.6  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0885  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.23 
 
 
733 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.81 
 
 
747 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  22.05 
 
 
247 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1894  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.1 
 
 
753 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818102  hitchhiker  0.00061937 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  31.03 
 
 
269 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1648  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.09 
 
 
741 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0787569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1159  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.3 
 
 
742 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123492  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  29.06 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  29.06 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1358  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.46 
 
 
739 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0562025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2238  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  26.52 
 
 
745 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.41 
 
 
736 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3389  GDP/GTP pyrophosphokinase  26.15 
 
 
744 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.59 
 
 
747 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  27.72 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1398  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.46 
 
 
739 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000892312  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1978  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.09 
 
 
741 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.699321  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1274  RelA/SpoT protein  30.25 
 
 
741 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4614  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.77 
 
 
744 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00159088  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0991  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.77 
 
 
745 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000121371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1473  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.77 
 
 
745 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0014242  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1588  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.41 
 
 
753 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.870499  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.69 
 
 
746 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1780  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.51 
 
 
744 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0214553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  27.69 
 
 
746 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3548  GDP/GTP pyrophosphokinase  26.15 
 
 
745 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000488354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1451  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.77 
 
 
745 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00161513  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0652  RelA/SpoT family protein  26.05 
 
 
750 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  26.97 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0645  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  26.05 
 
 
750 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0910  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.71 
 
 
726 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.746196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  26.05 
 
 
216 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1899  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.68 
 
 
758 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0360042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  25.97 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  26.72 
 
 
747 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1217  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  26.92 
 
 
746 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212214  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  26.95 
 
 
221 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  27.64 
 
 
290 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2928  GDP/GTP pyrophosphokinase  28.57 
 
 
744 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000188713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0904  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.57 
 
 
744 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  26.44 
 
 
223 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2922  GDP/GTP pyrophosphokinase  28.57 
 
 
744 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000016084  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3089  GDP/GTP pyrophosphokinase  28.57 
 
 
744 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000014869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3392  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  26.79 
 
 
743 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>