89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2442 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  100 
 
 		 340 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  37.98 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  36.26 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  30.37 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  31.56 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000576608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1321  RelA/SpoT domain-containing protein  26.92 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000180036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0840  RelA/SpoT  26.92 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000281443  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  36.21 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  33.04 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  33.04 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  27.83 
 
 		 239 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  35.14 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  35.09 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  34.23 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  33.33 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  33.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  31.06 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  31.25 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  31.06 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  34.48 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  33.04 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  35.04 
 
 		 216 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  32.48 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  30.3 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  30.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  30.3 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  33.59 
 
 		 217 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  31.9 
 
 		 274 aa  49.3  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  34.59 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  32.8 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  32.8 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  31.93 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  27.97 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  31.82 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  30.97 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  34.48 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  31.86 
 
 		 247 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  30.77 
 
 		 204 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.03 
 
 		 705 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  29.03 
 
 		 705 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  27.97 
 
 		 247 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11397  hypothetical protein  26.4 
 
 		 273 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02591  hypothetical protein  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000104096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0815  GDP/GTP pyrophosphokinase  37.68 
 
 		 745 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3389  GDP/GTP pyrophosphokinase  37.68 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3548  GDP/GTP pyrophosphokinase  37.68 
 
 		 745 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000488354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0904  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4044  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000409177  normal  0.332873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3276  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00140611  normal  0.0304818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.23 
 
 		 705 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0223055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02629  (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000829976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2928  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000188713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3088  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000221392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0928  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000382583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2922  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000016084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3089  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000014869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3178  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00141228  normal  0.185279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3162  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00447218  normal  0.0412564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3115  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3097  GDP/GTP pyrophosphokinase  39.13 
 
 		 744 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000040075  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2565  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 710 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00145552  hitchhiker  0.00000902572 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0095  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  36.23 
 
 		 745 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000291848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  32.06 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3236  GDP/GTP pyrophosphokinase  42.11 
 
 		 743 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000465507  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  32.76 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  30.25 
 
 		 714 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0849  GDP/GTP pyrophosphokinase  40.35 
 
 		 746 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000221192  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  29.46 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  35.56 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  28.45 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.77 
 
 		 705 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  29.06 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2518  GTP pyrophosphokinase  26.43 
 
 		 745 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.326663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2029  GTP pyrophosphokinase  28.69 
 
 		 738 aa  42.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0530  (p)ppGpp synthetase I and guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  32.08 
 
 		 737 aa  43.1  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000055023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>