81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3432 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3432  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  704    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000798174  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0452  RelA/SpoT domain protein  48.17 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000576608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  30.37 
 
 
340 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  33.33 
 
 
353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  25.5 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1321  RelA/SpoT domain-containing protein  23.6 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000180036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0840  RelA/SpoT  23.6 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000281443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  34.88 
 
 
212 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  34.19 
 
 
215 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  34.19 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  34.71 
 
 
210 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  34.19 
 
 
212 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  26.78 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  33.88 
 
 
212 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  40.45 
 
 
223 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  33.61 
 
 
226 aa  56.6  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  27.17 
 
 
269 aa  56.2  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  33.9 
 
 
217 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  27.23 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  33.86 
 
 
204 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  29.13 
 
 
223 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  35.65 
 
 
208 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  30.47 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  30.3 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  31.62 
 
 
211 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  31.62 
 
 
211 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  26.58 
 
 
230 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  26.58 
 
 
230 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  32.56 
 
 
256 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  29.92 
 
 
247 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  28.1 
 
 
216 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  28.93 
 
 
216 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  28.1 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  28.1 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  28.1 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  32.48 
 
 
224 aa  50.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.03 
 
 
717 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  31.4 
 
 
267 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  27.27 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  33.88 
 
 
722 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  27.27 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  27.27 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  27.27 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  27.27 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.41 
 
 
740 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  29.48 
 
 
714 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  31.71 
 
 
191 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  28.93 
 
 
216 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  30.77 
 
 
263 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  30.77 
 
 
263 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  28.77 
 
 
229 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2071  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  30.58 
 
 
751 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000208286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0530  (p)ppGpp synthetase I and guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  34.58 
 
 
737 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000055023  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.66 
 
 
747 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0787  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.96 
 
 
722 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.239727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  26.72 
 
 
261 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  31.01 
 
 
290 aa  47  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1920  GTP pyrophosphokinase  31.11 
 
 
718 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.682982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  30.37 
 
 
230 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.17 
 
 
736 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  26.54 
 
 
203 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  26.81 
 
 
224 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3149  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.4 
 
 
747 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439153  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2496  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.4 
 
 
747 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1536  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.5 
 
 
719 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  29.23 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  24.43 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  26.32 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1212  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.17 
 
 
716 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3879  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  28.26 
 
 
701 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1462  GTP pyrophosphokinase  32.43 
 
 
714 aa  42.7  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00122903  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2565  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 
710 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00145552  hitchhiker  0.00000902572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.04 
 
 
705 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  33.04 
 
 
705 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>