More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4468 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4468  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2753  integrase, catalytic region  98.17 
 
 		 246 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  99.52 
 
 		 304 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  99.05 
 
 		 304 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  54.29 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  50.48 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  43.65 
 
 		 294 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  43.78 
 
 		 280 aa  141  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  43.78 
 
 		 280 aa  141  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  43.65 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  43.65 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  43.65 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  43.65 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  43.65 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.13 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1980  integrase catalytic subunit  38.78 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.340546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  38 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  35.68 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0652  integrase catalytic subunit  38.78 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1991  integrase catalytic subunit  38.78 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  38.78 
 
 		 289 aa  131  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  43.41 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  39.89 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  39.89 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  39.89 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  39.89 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  38.89 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  41.44 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  39.78 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.33 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.33 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.33 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.33 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.33 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5539  transposase  41.71 
 
 		 203 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.0199842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  35.82 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  41.21 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  37.76 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  38.3 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  38.55 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  38.55 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  41.21 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  41.21 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  41.21 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  38.55 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  41.21 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  38.55 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  38.55 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  35.15 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  41.21 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  41.4 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  40.66 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  36.87 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  36.87 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  35 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  35 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  35 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  37.3 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4401  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.518435 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  37.7 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  37.7 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  35.36 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1013  integrase catalytic subunit  37.57 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  38.25 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1295  integrase catalytic subunit  38.25 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  38.25 
 
 		 280 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  37.57 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0017  IS30 family transposase  36.67 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1687  IS30 family transposase  36.67 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  34.64 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  35.33 
 
 		 300 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>