More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0645 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  100 
 
 		 300 aa  633  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0017  IS30 family transposase  78.34 
 
 		 272 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1687  IS30 family transposase  78.34 
 
 		 272 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  77.98 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0599  IS30 family transposase  73.06 
 
 		 292 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  76.9 
 
 		 272 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  76.9 
 
 		 272 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  76.9 
 
 		 272 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  61.81 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  61.81 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  61.81 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  61.81 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  61.81 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  61.81 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  61.81 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  61.81 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  66.2 
 
 		 208 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 286 aa  271  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  49.06 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  45.99 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.68 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  44.68 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  45.13 
 
 		 272 aa  254  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  44.77 
 
 		 272 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  44.77 
 
 		 272 aa  252  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  44.77 
 
 		 272 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  44.4 
 
 		 272 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  44.04 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  45.28 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  43.68 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  43.68 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  43.68 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  43.68 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  43.68 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  43.68 
 
 		 272 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  42.96 
 
 		 272 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0926  IS30 family transposase  88.14 
 
 		 118 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  40 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  38.65 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  38.65 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  38.65 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  38.65 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  38.65 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  38.65 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  38.65 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  43.02 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  43.02 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  40.75 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  41.32 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  41.32 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  39.04 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  39.04 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  39.5 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  39.5 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  39.5 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  39.5 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  40.07 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  40.07 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  40.07 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  40.07 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  38.23 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  38.23 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  38.23 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  38.69 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  38.69 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.77 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.77 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.77 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.77 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  39.63 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  38.77 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  40.14 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  40.14 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  40.14 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  40.14 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  40.61 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  40.14 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  41.13 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  41.13 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  41.13 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  41.13 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  41.13 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  41.22 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  39.03 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>