More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1660 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  100 
 
 
272 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  99.63 
 
 
272 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  98.9 
 
 
379 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  99.26 
 
 
272 aa  568  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  98.9 
 
 
272 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  98.9 
 
 
272 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  98.9 
 
 
294 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  98.16 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  98.53 
 
 
272 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  98.16 
 
 
272 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  90.81 
 
 
272 aa  521  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  69.4 
 
 
274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  69.4 
 
 
286 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0096  ISSd1, transposase OrfB  97.87 
 
 
244 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00302265  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  58.15 
 
 
275 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  51.13 
 
 
270 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  51.13 
 
 
270 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  51.5 
 
 
270 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  51.5 
 
 
270 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  51.5 
 
 
270 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  51.5 
 
 
270 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  51.5 
 
 
270 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
284 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
284 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
284 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
284 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
284 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
284 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
284 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  49.26 
 
 
284 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  49.23 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0017  IS30 family transposase  45.59 
 
 
272 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1687  IS30 family transposase  45.59 
 
 
272 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0638598  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0599  IS30 family transposase  48.8 
 
 
292 aa  259  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  47.15 
 
 
277 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  45.59 
 
 
272 aa  256  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  44.85 
 
 
272 aa  255  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  44.85 
 
 
272 aa  255  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  44.85 
 
 
272 aa  255  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  44.04 
 
 
300 aa  248  8e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  42.12 
 
 
289 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  42.12 
 
 
289 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  42.12 
 
 
289 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  42.39 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  42.39 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  43.28 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  43.28 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  43.07 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  43.28 
 
 
296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  43.28 
 
 
296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  43.28 
 
 
296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  43.28 
 
 
296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.53 
 
 
286 aa  241  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  43.91 
 
 
296 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  43.91 
 
 
296 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  43.91 
 
 
296 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  43.91 
 
 
296 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  43.91 
 
 
296 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  43.91 
 
 
296 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  43.91 
 
 
296 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.53 
 
 
286 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.53 
 
 
286 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.53 
 
 
286 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  47.53 
 
 
286 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06247  integrase  47.76 
 
 
283 aa  241  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  45.22 
 
 
291 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  47.39 
 
 
302 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  44.49 
 
 
289 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  47.39 
 
 
293 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  44.12 
 
 
297 aa  238  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>