More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0620 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  58.22 
 
 
304 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  57.24 
 
 
304 aa  350  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  51.01 
 
 
296 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  44.73 
 
 
294 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2753  integrase, catalytic region  54.29 
 
 
246 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4468  hypothetical protein  54.29 
 
 
267 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504952  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  41.09 
 
 
277 aa  225  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  40.43 
 
 
291 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  42.21 
 
 
281 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  41.58 
 
 
286 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  41.61 
 
 
274 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  42.91 
 
 
267 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  40.68 
 
 
289 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  42.91 
 
 
269 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  42.91 
 
 
267 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
296 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  40 
 
 
289 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  42.75 
 
 
278 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  41.83 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  41.83 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  41.83 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  41.83 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  41.83 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  40.34 
 
 
289 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  42.48 
 
 
286 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  42.48 
 
 
286 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  42.48 
 
 
286 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  41.57 
 
 
286 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  41.57 
 
 
286 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  42.11 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  42.48 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  42.11 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  42.11 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  42.11 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  42.11 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  42.11 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  38.58 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  42.11 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  42.11 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.84 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.84 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  40.46 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  40.46 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  40.46 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  40.46 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  40.46 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  37.83 
 
 
272 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  37.83 
 
 
272 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  37.83 
 
 
272 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0017  IS30 family transposase  37.83 
 
 
272 aa  195  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1687  IS30 family transposase  37.83 
 
 
272 aa  195  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0638598  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  40.15 
 
 
291 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  40.15 
 
 
291 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  39.78 
 
 
296 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  39.78 
 
 
296 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  39.78 
 
 
296 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  39.78 
 
 
296 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  40.28 
 
 
286 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  38.43 
 
 
288 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  37.32 
 
 
300 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  43.07 
 
 
295 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  41.2 
 
 
295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  41.2 
 
 
295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  41.2 
 
 
295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  41.2 
 
 
295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  41.2 
 
 
295 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  39.49 
 
 
291 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  39.49 
 
 
291 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  39.49 
 
 
291 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  39.49 
 
 
291 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  39.49 
 
 
291 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  39.49 
 
 
291 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  39.49 
 
 
291 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  38.32 
 
 
272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  38.27 
 
 
379 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>