More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1384 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  100 
 
 		 304 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  99.01 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2753  integrase, catalytic region  99.52 
 
 		 246 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4468  hypothetical protein  99.52 
 
 		 267 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  57.24 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  51.16 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  44.4 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  41.42 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  43.6 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  43.6 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  43.6 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  43.6 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  43.6 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  40.96 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  43.82 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  42.7 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  42.44 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  40.88 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  42.97 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  40.88 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4466  integrase, catalytic region  100 
 
 		 104 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  40.75 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  40.15 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  39.03 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  42.48 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  42.48 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  42.48 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  38.91 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  38.91 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  42.48 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  39.48 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03751  Integrase  40.22 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.589934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01551  integrase  40.22 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.648789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02081  Integrase  40.22 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.922078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  37.09 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  38.2 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.84 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.84 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.84 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.84 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.84 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  38.49 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  38.49 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  38.49 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  37.36 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  37.36 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  37.36 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>