More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3664 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  100 
 
 
294 aa  611  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  46.64 
 
 
291 aa  258  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  46.44 
 
 
277 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  44.77 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  47.46 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  44.44 
 
 
281 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  42.38 
 
 
280 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  42.38 
 
 
280 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  42.38 
 
 
280 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.41 
 
 
288 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  43.56 
 
 
270 aa  235  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  43.56 
 
 
270 aa  235  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  43.56 
 
 
270 aa  235  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  43.56 
 
 
270 aa  235  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  43.56 
 
 
270 aa  235  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  42.8 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  42.8 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  47.37 
 
 
285 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  44.73 
 
 
301 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  42.96 
 
 
286 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  42.96 
 
 
286 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  42.96 
 
 
286 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  42.96 
 
 
286 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  42.96 
 
 
286 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  45.52 
 
 
304 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 
271 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 
271 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 
271 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  40 
 
 
272 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  42.49 
 
 
286 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  45.09 
 
 
291 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.74 
 
 
286 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.74 
 
 
286 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.74 
 
 
286 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.74 
 
 
286 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.74 
 
 
286 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  42.49 
 
 
286 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  42.49 
 
 
286 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  42.49 
 
 
286 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  42.49 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  44.4 
 
 
304 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  42.12 
 
 
286 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  42.66 
 
 
286 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  43.12 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0732  integrase catalytic region  44.53 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0157  integrase catalytic region  44.53 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  44.53 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  43.06 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  41.88 
 
 
289 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  39.55 
 
 
278 aa  219  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  42.81 
 
 
291 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  42.81 
 
 
291 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  39.48 
 
 
285 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  43.8 
 
 
289 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  43.8 
 
 
289 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  43.8 
 
 
289 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  43.68 
 
 
291 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  43.68 
 
 
291 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  43.68 
 
 
291 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  43.68 
 
 
291 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  43.68 
 
 
291 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  43.68 
 
 
291 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  43.68 
 
 
291 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  41.61 
 
 
293 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  41.61 
 
 
293 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  41.61 
 
 
293 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  44.98 
 
 
281 aa  215  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  42.86 
 
 
296 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  38.1 
 
 
294 aa  215  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  38.1 
 
 
294 aa  215  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>