More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2398 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  61.85 
 
 
296 aa  323  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  57.6 
 
 
319 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  52.06 
 
 
281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  62.21 
 
 
232 aa  270  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  48.68 
 
 
271 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  48.68 
 
 
271 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  48.68 
 
 
271 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  51.69 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  44.4 
 
 
270 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  49.06 
 
 
286 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  49.06 
 
 
286 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  49.06 
 
 
286 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  43.28 
 
 
270 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  43.28 
 
 
270 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  48.69 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  48.69 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  48.69 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  48.69 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  48.69 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  48.69 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  48.69 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  48.69 
 
 
286 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  44.16 
 
 
277 aa  244  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  49.06 
 
 
286 aa  244  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  47.57 
 
 
286 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  47.57 
 
 
286 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  46.62 
 
 
280 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  46.62 
 
 
280 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  43.43 
 
 
291 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  43.57 
 
 
302 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  45.28 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  47.55 
 
 
294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  46.67 
 
 
286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  44.53 
 
 
293 aa  234  9e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  43.21 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  46.62 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  46.62 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  46.62 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  46.62 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  46.62 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  44.15 
 
 
293 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  42.7 
 
 
285 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  47.39 
 
 
288 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  44.12 
 
 
281 aa  224  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  42.86 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  42.86 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  42.86 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  42.86 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  42.86 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  42.86 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  42.86 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  42.86 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  43.98 
 
 
286 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  44.15 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  43.43 
 
 
291 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  43.23 
 
 
280 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  43.23 
 
 
280 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  44.15 
 
 
289 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  43.23 
 
 
280 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  44.15 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.65 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.65 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.65 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.65 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  44.65 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  44.69 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  44.69 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  44.69 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  45.35 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  43.98 
 
 
272 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  42.96 
 
 
296 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  42.96 
 
 
296 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  42.96 
 
 
296 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  39.03 
 
 
294 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  39.03 
 
 
294 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  39.03 
 
 
294 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  39.03 
 
 
294 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  39.03 
 
 
294 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  42.09 
 
 
279 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  43.23 
 
 
296 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  43.23 
 
 
296 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  43.23 
 
 
296 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  43.23 
 
 
296 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  42.96 
 
 
296 aa  208  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>