More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4705 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  100 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  61.19 
 
 
285 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  58.52 
 
 
319 aa  294  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4818  integrase catalytic subunit  75.53 
 
 
207 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  60.18 
 
 
232 aa  262  4.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  50.37 
 
 
281 aa  258  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  49.47 
 
 
291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  44.53 
 
 
270 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  44.53 
 
 
270 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  44.53 
 
 
270 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  44.53 
 
 
270 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  44.53 
 
 
270 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  43.61 
 
 
277 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.67 
 
 
281 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  47.46 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  42.86 
 
 
270 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  42.86 
 
 
270 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  48.69 
 
 
271 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  48.69 
 
 
271 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  48.69 
 
 
271 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  45.14 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  45.14 
 
 
286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  41.1 
 
 
293 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  41.1 
 
 
302 aa  232  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  41.1 
 
 
302 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  41.1 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  45.61 
 
 
286 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  45.26 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  40.28 
 
 
291 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  45.26 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  45.26 
 
 
286 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  45.26 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  45.26 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  45.26 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  45.26 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  45.26 
 
 
286 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  43.97 
 
 
285 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  42.75 
 
 
272 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  42.27 
 
 
290 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  44.56 
 
 
286 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  45.07 
 
 
291 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  44.25 
 
 
289 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  42.96 
 
 
286 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  42.55 
 
 
285 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  42.21 
 
 
293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  42.21 
 
 
293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  42.21 
 
 
293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  41.96 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  41.96 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  41.96 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  41.96 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  37.68 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  37.68 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  37.68 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  37.68 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  37.68 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  41.22 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  41.22 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  44.01 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  43.46 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  42.55 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  42.2 
 
 
296 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  44.52 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  42.55 
 
 
296 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  42.55 
 
 
296 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  42.55 
 
 
296 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  42.55 
 
 
296 aa  212  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  42.64 
 
 
274 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  42.96 
 
 
289 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  43.38 
 
 
277 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  45.63 
 
 
296 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  40.49 
 
 
294 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  45.63 
 
 
296 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>